گرجستان شرقى را به عهده گرفتند ) ، لشكركشى آقا محمد خان در بهار 1796 همراه با تاراجگرى و ويرانگرى سرزمينهاى اشغالى آغاز گرديد . در سپتامبر 1795 يكانهاى آقا محمد خان وارد تفليس شدند . با وجود پايدارى بىباكانه ارتش گرجستان ، دستههاى ايرانى آنها را درهم شكستند وارد شهر شدند ، پس از تاراج و ويرانى ددمنشانه شهر را به آتش كشيدند . هزاران تن از ساكنان تفليس ، ازجمله پيران ، زنان و كودكان قتلعام شدند ، فقط 12 هزار تن از ساكنان كه اسير شده بودند ، به عنوان برده به تهران اعزام گرديدند . اعمال اين گونه رفتارهاى ددمنشانه ، نابودى و به بردگى بردن هزاران تن از مردم ، ويران كردن يادگارهاى تاريخى و فرهنگى گرانبها و غيره را آقا محمد خان و نزديكانش به حساب پيكار به خاطر رواج دين اسلام گذاشتند . هجوم تاراجگرانهء آقا محمد خان به گرجستان ، بيرحمى و ددمنشى ارتش بىشمارش باعث نفرت و بيزارى هرچه ژرفتر گرجيان و ساكنان خاننشين ماوراء قفقاز نسبت به اشغالگران گرديد و پندار پيوستگى اين مناطق به خاك روسيه هرچه بيشتر نيرو گرفت .
كشته شدن آقا محمد خان قاجار
آقا محمد شاه سپس با ارتشش به سوى خاور رهسپار شد تا آخرين استان مهم ايران يعنى خراسان را مطيع كند ، در اين هنگام نادر ميرزا پسر شاهرخ كور ، خراسان را فرمانروائى مىكرد . هدف ديگر از اين لشكركشى آن بود كه آقا محمد خان مىخواست گنجهاى نادر شاه را كه از هندوستان آورده و گويا در اختيار شاهرخ بود تصرف كند . هنگاميكه ارتش آقا محمد - خان به مشهد نزديك مىشد نادر ميرزا به افغانستان گريخت .
پس از چيرگى بر خراسان آقا محمد شاه دوباره به سوى گرجستان و خاننشين ماوراء قفقاز رهسپار شد . هنگام محاصره دژ شوشى در ماه مه 1797 در پى توطئه درباريانش كشته شد .
پس از كشته شدن آقا محمد خان ، خانها و رهبران عشاير كه رهبرى يكانهاى ارتش او را به عهده داشتند اردوگاه شوشى را ترك كردند و اين گونه ارتش مأمور محاصره شوشى ازهم پاشيد .
ديرى نپائيد كه دوباره آتش پيكار ، به منظور به دست گرفتن قدرت ميان وارث تاج و تخت يعنى فتحعلى خان و مدعيان ديگر سلطنت شعلهور شد . در خراسان نادر ميرزا به كمك ارتش افغان بهپا خاست و مشهد را تصرف كرد . خانهاى خراسان كه نمىخواستند به اطاعت قاجاران گردن نهند به او پيوستند . در منطقه قزوين و سلطانيه صادق خان شكاكى