توفّي العلامة النجفي يوم الأحد 24 محرّم 1362 ودفن في تخت فولاد عند جدّه .
قال الميرزا حبيب الله النير في وفاته :
أيا دهراً ذهبتَ بآية الله * غدرت بنا فوا أسفا ولهفاه
محمّد الرضا الغروي أبوالمجد * مضى نحو الجنان بقرب مولاه
أراد النير استيضاح فوته * ففي شهر المحرّم طاب مثواه
فأرّخ بعد نقض الستّ للعام : * رضا النجفي لبّي داعي الله
وقال الحاج الميرزا حسن خان الجابري في ذلك :
لقد أفل الكواكب مذ توفّي * رئيس العلم في ذاك الزمان
محمّد الرضا الغروي شيخٌ * سما علماً لأهل الاصبهان
ولمّا راح راح الروح عمّا * به شاد البيان من المعاني
تمنّي الجابري أن يورّخ * وكلّ لسانه عند البيان
إذاً جاء البشير وقال أرّخ : * لقد آوي الرضاء بالجنان
وخلف من العلوية زهرا بيگم بنت العالم الجليل السيد محمّد الإمامي الخاتون آبادي ولديه : الشيخ مجد الدين ( مجد العلماء ) والشيخ عزّ الدين النجفي .
. . .