3 - شرح ( صدور مقالات أقليدس ) لابن الهيثم .
4 - ( شرح ما لا يحضره الفقيه ) للمجلسي ، الجزء الأول .
5 - ديوان ( القيراطي ) .
6 - ( الخلاف ) للشيخ الطوسي ومنه نسخة في مكتبة الإمام الحكيم .
7 - ( رجال الخليلي ) تأليف الحاج ملا علي الخليلي في علم ( الرجال ) وتراجمهم .
8 - رجال ( اللاهجي ) للملا محسن فيض .
9 - ( درة التاج ) في الهندسة .
10 - ( غاية المرام ) للصيمري .
11 - كتاب ( عن نبوخذ نصر ) مكتوب على رق الغزال ومخطوط قبل الاسلام .
12 - ( نثر الدرر ) للوزير الآبي ، ويقول الشيخ جعفر محبوبة ان هذا الكتاب قد اخذه محمد امين الخانجي المصري عند مجيئه النجف ليطبعه في مصر فلما وصل محله راجع الشيخ بضياع الكتاب ثم أضاف الشيخ جعفر قائلا ( هكذا فليكن الأمين ) « 1 »
13 - ( تذكرة العين ) لعلي بن عيسى ولهذا الكتاب قصة ملخصها ان هذه النسخة فريدة وهي مفقودة وقد جاءنا من جامعة ( مشيغن ) عن
هامش
( 1 ) ماضي النجف وحاضرها ج 1 ص 113 . مستخلص من كتاب ( نهج الصواب ) .