در سن شصت و پنجسالگى رحلت فرمود و در بقيع كنار جد و پدر و عمويش حسن آرميد .
و مادرش ام فروه دختر قاسم بن محمد و مدت امامتش سى و چهار سال بود .
و پدر بزرگوارش او را بالصراحه وصى خود قرار داد و علنا مقام امامت او را امضا كرد .
( 1 ) 1 - هشام بن سالم از حضرت صادق ع روايت كرده هنگامى كه رحلت پدر بزرگوارم دررسيد فرمود اى جعفر به تو وصيت مىكنم نسبت به ياران من به نيكى معامله نمائى ، عرضكردم خدا مرا فداى شما گرداناد سوگند به حضرت كردگار بقدرى علم و دانش در ميان ياران و اصحاب پراكنده بسازم كه به هيچ فاضل و دانشمندى نيازمند نشوند .
( 2 ) 2 - ابو صباح كنانى گويد حضور حضرت ابو جعفر شرفياب بودم حضرت نظرى به فرزند ارجمندش كرده به من فرمود اين فرزند مرا كه مىبينى مصداق اين آيه شريفه است كه خدا مىفرمايد :
وَ نُرِيدُ أَنْ نَمُنَّ عَلَى الَّذِينَ اسْتُضْعِفُوا فِي الْأَرْضِ وَ نَجْعَلَهُمْ أَئِمَّةً وَ نَجْعَلَهُمُ الْوارِثِينَ
ما اراده كردهايم منت گذاريم بر آنها كه ظاهرا در روى زمين ، ضعيف و ناتوان بشمار آمدهاند تا آنها را پيشوايان مردم و وارثان علم و كمال خود قرار دهيم .
( 3 ) 3 - از حضرت ابو جعفر سؤال كردند امام پس از شما كيست ؟ حضرت دست بر پشت مبارك امام صادق ع زده فرمود سوگند به خدا اين همان كسى است كه بايد آئين آل محمد عليهم السّلام را احيا كند .
( 4 ) 4 - طاهر ، مصاحب امام ابو جعفر ع گفت حضور حضرتش شرفياب بودم ، جعفر ع وارد شد حضرت