سيد محمّد تقى حكيم ، شيخ محمّد تقى مجلسى ، محمّد تقى هرندى ، شيخ محمّد جواد آل راضى ، سيد محمّد حسين حكيم ، شيخ محمّد جواد مغنيه ، سيد محمّد حسين فضل اللّه ، سيد محمّد سرور بهسودى افغانى ، شيخ محمّد على توحيدى ، سيد محمّد مهدى خلخالى ، محمّد مهدى شمس الدين ، محمود انصارى قمى ، سيد مرتضى حسينى فيروزآبادى ، مرتضى نجفى بروجردى ، سيد مرتضى نجومى ، مسلم ملكوتى سرابى ، موسى شراره ، سيد موسى صدر ، سيد موسى مازندرانى ، سيد مهدى مرعشى ، آقا نجفى شهرستانى ، هادى آل راضى ، هاشم معروف حسنى ، سيد يوسف حكيم
تقريرات
شاگردان آيت اللّه خويى در خلال تحصيل خود ، همواره به ضبط بيانات استاد در فقه و اصول پرداخته و در مجلس درس وى به نگاشتن افادات ايشان اشتغال داشتهاند . لذاست كه شمارش تقريرات درس آيت اللّه فقيد بسان شمارش شاگردان ايشان كارى دشوار و نيازمند وقت وسيعى است .
در اينجا تنها به برخى از تقريرات چاپ شده آن استاد بزرگوار اكتفا مىشود .
الف . فقه
1 . التنقيح فى شرح العروة الوثقى ( مباحث اجتهاد و تقليد ، طهارت ، صلات ) شهيد حاج ميرزا على غروى تبريزى ، 9 جلد تاكنون
2 . تحرير العروة الوثقى ، شيخ قربانعلى كابلى
3 . معتمد العروة الوثقى ، شهيد سيد رضا خلخالى ، 2 جلد تاكنون
4 . مستند العروة الوثقى ( مباحث صلوة ، خمس ، صوم ، اجاره ) ، شهيد شيخ مرتضى بروجردى ، 10 جلد تاكنون
5 . مبانى العروة الوثقى ( مباحث : مضاربه ، مزارعه ، شركت ، ضمان ، حواله ،