حضرت امام خمينى رحمه الله در پاسخ ، توصيه فرمودند كه بايد مقاومت كنيد . به اين ترتيب ايشان در اردبيل باقى ماند و به مقاومت ادامه داد تا اينكه در نتيجهء اين پايدارىها ، رژيم شاهْ ايشان را از اردبيل تبعيد كرد .
پس از پايان يافتن دوران تبعيد ، ايشان بار ديگر به اردبيل باز گشت . مأموران رژيم شاه نيز فشارها و كارشكنىهاى خود را در برابر فعّاليّتهاى ايشان و اطرافيانشان شدت بخشيدند و طلبههاى حوزهء علميهء اردبيل را به اجبار متفرق كردند تا حوزهء علميهء اين شهر تعطيل شود . ديگر كسى نمىتوانست با ايشان تماس بگيرد ، چون بلافاصله دستگير مىشد . در نتيجه ، حضرت آيت اللَّه العظمى موسوى اردبيلى در سال 1347 ش .
شهرستان اردبيل را به قصد اقامت در حوزهء علميهء قم ترك نمود . حضرت آيت اللَّه شهيد مطهرى با اصرار فراوانْ ايشان را در تهران نگاه داشتند و مانع از بازگشت ايشان به حوزهء علميهء قم شدند .
آيت اللَّه العظمى موسوى اردبيلى در تهران با همكارى شهداى گرانقدر ، آيت اللَّه دكتر بهشتى ، آيت اللَّه مطهرى و همچنين آيت اللَّه مهدوى كنى - كه بعداً به زندان افتادند - به فعاليت پرداخت . ايشان در سال 1348 ش . براى انجام فعّاليّتهاى فرهنگى ، مؤسسهء خيريهء مكتب امير المؤمنين را در كنار مسجد امير المؤمنين تأسيس نمود .
در اين مركزْ حضرات آياتْ شهيد دكتر بهشتى ، شهيد دكتر مفتح ، مهدوى كنى ، امامى كاشانى و سيد جمال زنجانى فعّاليّت علمى و فرهنگى داشتند . ايشان در تهران علاوه بر اقامهء نماز جماعت در مسجد امير المؤمنين عليه السلام ، جلسات تدريس خارج فقه ( كتاب خمس ) و فلسفه ( كتاب اسفار ) را براى طلّاب مستعد حوزهء علميهء تهران تشكيل دادند . حضرت آيت اللَّه العظمى موسوى اردبيلى با همكارى دوستان خود در مكتب امير المؤمنين عليه السلام به طور مرتب پس از اقامهء نماز مغرب و عشا ، جلسات تفسير قرآن برگزار مىنمودند .
در آن دوران ، انديشههاى الحادى در ايران گسترش زيادى يافته بود . از اين رو تأسيس
همپاى انقلاب (خطبه هاى نماز جمعه) (فارسى) — صفحة پيشگفتار 12
مساهمون: السيد عبد الكريم الموسوي الاردبيلي
صپيشگفتار ١٢