مرحوم علامه شيخ ابو جعفر فخر الدين محمد فرزند وى بوده است كه در فضل و فهم و ورع و زهد و تقوا و مراتب علمى و كمالات نفسانى در نهايت درجه كمال و وارث بالاستحقاق جدّ و پدر و الا مقام خويش بوده و از شاگردان پدرش صاحب معالم ، ميرزا محمد استرآبادى صاحب آيات الاحكام و رجال و صاحب مدارك به شمار مىآمده است .
تأليفات او عبارتند از :
1 - استقصاء الاعتبار فى شرح الاستبصار
2 - تحفة الدهر فى منازعة الغنى و الفقر
3 - تزكية الراوى
4 - روضة الخواطر و نزهة النواظر ( كشكول و در برگيرنده اشعار خود و ديگران است ) .
5 - حاشيه اصول كافى
6 - حاشيه تهذيب الاحكام
7 - حاشيه من لا يحضره الفقيه
8 - حاشيه تلخيص الاقوال
9 - حاشيه منهج المقال
10 - حاشيه تهذيب الاصول
11 - حاشيه معالم الاصول
12 - حاشيه خلاصة الاقوال
13 - حاشيه معالم العلماء
14 - حاشيه شرح لمعه
15 - حاشيه مختلف الشيعه
16 - حاشيه مدارك الاحكام
17 - حاشيه مطول تفتازانى
18 - ديوان اشعار