11 - شرح الالفية و النفلية شهيد اول
12 - معالم الدين و ملاذ المجتهدين . كه مقدمه اصولى آن تا اين زمان يكى از مشهورترين كتابهاى اصولى شيعه بوده و بر آن دهها شرح و حاشيه و ترجمه نگاشته شده و مؤلف نيز به صاحب معالم شهرت يافته و فصل طهارت آن نيز - كه اجل مهلت اتمام آن را به دو نداد - مشهور به فقه معالم بوده و به چاپ رسيده است .
13 - مشكاة القول السديد فى تحقيق معنى الاجتهاد و التقليد .
14 - مناسك الحج
15 - منتقى الجمان فى الاحاديث الصحاح و الحسان در عبادات .
وى در اين كتاب تمام احاديث را اعراب گذاشت و مىفرمود : همين موافق احتياط است . زيرا شيخ كلينى از امام صادق عليه السّلام روايت كرده است كه فرمود :
اعرابوا احاديثنا فانّا قوم فصحاء
16 - ديوان شعر
17 - مجموع اشعار و فوايد و فرايد خود و ديگران .
اجازات :
از آنجا كه مرحوم صاحب معالم در هنگام شهادت پدر بزرگوارش هفت ساله بود ، لذا با واسطه از پدرش روايت مىنمايد . مشايخ اجازه وى عبارتند از :
1 - سيد على بن ابى الحسن موسوى عاملى - پدر صاحب مدارك -
2 - سيد على صايغ عاملى - از بزرگترين شاگردان شهيد ثانى -
3 - شيخ حسين بن عبد الصمد عاملى - پدر شيخ بهايى -
كه هر سه از افاضل شاگردان شهيد ثانى بوده و از او روايت مىنمايند .
فرزندان و نوادگان :
شيخ حسن صاحب معالم سر سلسله خاندان علمى بزرگى بوده ، كه تاكنون به خدمات علمى اشتغال دارند . عالم فقيه محدث رجالى اديب اصولى