4 - كتاب معتمد الشيعة في أحكام الشريعة .
5 - كتاب التحفة الرضويّة في المسائل الدينيّة .
6 - كتاب التجريد في أصول الفقه .
7 - كتاب في أصول الدين ، فارسي . وقد طبع أيضا .
8 - رسالة المعاملات ، سمّاها أنيس النجّار .
9 - رسالته في العبادات .
10 - كتابه في منسك الحاج .
11 - كتاب في علم الحساب .
12 - كتابه في عزاء الحسين عليه السّلام ، سمّاه محرق القلوب .
ولهذا الفاضل عدّة شيوخ أعاظم ، أولهم العلّامة الثاني المحقّق البهبهاني ، وثانيهم الفقيه المحدّث صاحب الحدائق ، وثالثهم علّامة الزمان محمد بن محمد زمان ، ورابعهم الفقيه المحدّث الشيخ محمد مهدي الفتوني العاملي ، وخامسهم العلم العلّامة المولى محمد إسماعيل المازندراني الخاجوئي ، وسادسهم العلّامة المتبحّر محمد مهدي الهرندي الأصفهاني . وكان بينه وبين السيد بحر العلوم الطباطبائي مودّة ومراسلة .
كتب النيراقي للسيد كتابا ضمّنه بهذين البيتين :
ألا قل لسكّان دار الحبيب * هنيئا لكم في الجنان الخلود
أفيضوا علينا من الماء شيئا * فإنا عطاشى وأنتم ورود
فأجابه السيد عن كتابه وضمّنه هذين البيتين :
ألا قل لمولى يرى من بعيد * ديار الحبيب بعين الشهود
فنحن على القرب نشكو الظما * وفزتم على بعدكم بالورود