1 - حاشية بر تفسير صافي ، كه نسخهء أصل آن در مجلّدى بزرگ در كتابخانهء مجلس شوراى اسلامى موجود است .
2 - حاشية بر أربعين حديث شيخ بهايى ، كه در دست تحقيق است .
3 - حاشية بر مدارك الأحكام ، در 2 جلد كه تا كنون به چاپ نرسيده .
4 - حاشية بر مشرق الشمسين شيخ بهايى .
5 - حاشية بر مفتاح الفلاح شيخ بهايى .
6 - الأربعين حديثا .
7 - جامع الشتات .
8 - مفتاح الفلاح في شرح دعاء الصباح .
9 - الفوائد الرجاليّة ، كه همگى به كوشش جناب آقاى سيد مهدى رجايى - سلّمه اللّه تعالى - به چاپ رسيده است .
10 - بشارات الشيعة ، كه به كوشش آقاى رجايى در مجموعهء الرسائل الاعتقاديّة محقّق خواجويى چاپ شده . اين كتاب توسّط عالم جليل مرحوم ملّا محمد إبراهيم بن محمد باقر نجمآبادى به فارسي ترجمه شده است .
11 - هداية الفؤاد إلى نبذ من أحوال المعاد ، كه توسط أستاذ ارجمند شيخ احمد روحاني ( شيخ الاسلام ) ترجمه شده است .
12 - حاشية بر أصول كافى .
13 - حاشية بر زبدة البيان مقدّس اردبيلى .
14 - حاشية بر حبل المتين شيخ بهايى .
خوشبختانه حدود 80 اثر از محقّق خواجويى به همّت بلند جناب آقاى رجايى تصحيح وچاپ شده است .
ميراث حوزه اصفهان ( رسائل إجالة الفكر للهندي وأجل محتوم ، تجسم الأعمال ، سهو النبي ووحدت وجود للخواجوئي ) — صفحة 80
مساهمون: مجموعة مؤلفين
ص٨٠