وفي أواخر تلك السنة كان « آغا محمد خان قاجار » ( 1 ) قد احتل « تفليس » عاصمة الكرج ، وعاد قاصدا خراسان لزيارة مقام الامام الثامن في الظاهر ، وضم خراسان إلى ملكه وسلب ما بقي من مجوهرات نادر شاه في يد « شاه رخ شاه » في الواقع . وجاء إليه « شاه رخ شاه » يصحبه الميرزا مهدي المشهدي أحد كبار علماء خراسان ، فاستقبله « آغا محمد » بالاحترام . ولكنه لم يلبث أن سجنه محتجا بأنه لم يسلم إليه كل المجوهرات النادرية ، وذلك أن بعضهم أوصل إلى « آغا محمد » بالسر أن « شاه رخ شاه » لا يزال يحتفظ بشيء من هذه المجوهرات . وكان الواقع كذلك . وأخذ يعذبه عذابا يوميا ، حتى أنه صب على رأسه مرة رصاصا مصهورا . فاضطر إلى الإقرار بما بقي لديه من الجواهر ودله على أماكنها ، ومنها ما كان مخبوءا في شقوق الجدران فدله عليه ( 2 ) فرفع عنه العذاب . ثم أمر « آغا محمد خان » ، بعد أن أوقع ما أوقع بشاه رخ شاه من عذاب ، بان يحمل وجميع متعلقيه إلى مازندران ، وكان « شاه رخ شاه » يومئذ في الرابعة والستين من عمره ، ليقيموا فيها . ولكن « شاه رخ شاه » توفي في الطريق قبل الوصول إلى مازندران . توفي في « دامغان » متأثرا بما حل به من تلك المصائب والبلايا ودفن فيها ، سنة 1210 ه‍ . وقيل توفي في المحرم سنة 1211 ه‍ . وقبره غير معروف .