از مردم متدين تهران و با حضور رهبر معظم انقلاب اسلامى حضرت آيت اللّه خامنهاى مدظله العالى تشييع و پس از 5 ساعت راهپيمايى به قم انتقال داده شد .
صبح شنبه 26 جمادى الثانى از اولين ساعات بامداد يكايك مردم عزدار شهرستان قم و شهرهاى دور و نزديك ( كاشان ، اصفهان ، تهران ، گلپايگان ، ارك ، ساوه ، همدان ، ملاير ، آشتيان ، محلات ، گرگان ، سارى و . . . ) راهى محل برگزارى تشييع - مسجد امام حسن مجتبى عليه السّلام ، در مدخل ورودى شهر - شده بودند .
قم در آن روز شاهد باشكوهترين تشييع جنازه يك مرجع تقليد بود . درياى مواج انسانها در خيابانهاى قم به حركت درآمده بود . همه سياهپوش و غرق ماتم و با چشمانى اشكبار نوحه سرداده بودند و به امام زمان و مقام رهبرى تسليت مىگفتند . سرانجام بدن شريف آن مرد الهى پس از 4 ساعت به حرم مطهر حضرت فاطمه معصومه عليها السّلام رسيد . و پس از نمازى باشكوه توسط خيل عزاداران به امامت آيت اللّه حاج شيخ لطف اللّه صافى گلپايگانى در مسجد بالاسر حضرت معصومه و در جوار تربت پاك استادش مرحوم آيت اللّه العظمى حاج شيخ عبد الكريم حائرى به خاك سپرده شد .
در پى ارتحال آن مرجع عاليقدر از سوى رهبر معظم انقلاب پيام تسليتى به اين شرح صادر شد :
بسم اللّه الرحمن الرحيم «
إِنَّا لِلَّهِ وَ إِنَّا إِلَيْهِ راجِعُونَ
با تأسف و اندوه فراوان ، خبر مصيبتبار فقدانى بزرگ و جبرانناپذير را دريافت كردم .
عالم بزرگ ، فقيه نامآور ، مرجع تقليد عظيم الشأن ، عبد صالح و تقى نقى زكى ، آيت اللّه العظمى آقاى حاج سيد محمّد رضا گلپايگانى - قدس اللّه نفسه و اعلى اللّه مقامه - دار فانى را وداع كردند و پس از عمرى مشحون از حسنات با نامهء عملى سرشار از خيرات و مبرات ، دعوت معبود را لبيك گفته به پيشگاه محاسبهء الهى شتافتند .