تعالى براى ايشان رحمت و مغفرت و براى علماى اعلام و حوزههاى علميه صبر و اجر خواستارم .
و السلام على عباد اللّه الصالحين روح اللّه الموسوى الخمينى »
حضرت آيت اللّه گلپايگانى ( ره ) نيز چنين فرمودند :
« بسم اللّه الرحمن الرحيم
ثلمة لا تسد و كسر لا يجبر
با كمال تأسف ، رحلت مرجع عالىقدر ، بقية السلف و اسوهء فضائل و تقوا و فقيه اهل بيت ، حضرت آيت اللّه آقاى حاج سيد احمد خوانسارى قدس سره را به آستان قدس حضرت بقية اللّه ارواح العالمين له الفداء و به محاضر علماى اعلام و حوزههاى علميه و به عموم ملت مسلمان و شيعيان جهان تسليت عرض مىكنم .
آن فقيد روحانيت ، در علم و عمل و مخالفت هوى و اطاعت مولا و ترك اقبال به دنيا و انقطاع الى اللّه و جامعيت علمى و تدريس و تأليف و عبادت و تواضع در بيش از نيم قرن ، مشار بالبنان و مسلم بين اقران بود . ضايعهء رحلت ايشان را نمىتوان با توصيفات بيان كرد ، و بيش از حد تصور با فقدان ايشان در حصن حصين رخنه افتاد .
إِنَّا لِلَّهِ وَ إِنَّا إِلَيْهِ راجِعُونَ .
محمّد رضا الموسوى الگلپايگانى »
مردم مسلمان تهران - كه بيش از 35 سال از محضر شريفش استفاده كرده و عشق به او را در كانون دلهايشان جاى داده بودند ، در حالى كه لباس سياه بر تن داشتند گرد بيت معظم له با چشمان اشكبار حلقه زدند ، به نوحهخوانى و سينهزنى پرداختند ، و با احترام فراوان و شركت يكپارچهء خود پيكر پاكش را تشييع كردند ، و آن را به قم انتقال دادند . در قم نيز ، در حالى كه صداى ملكوتى قرآن از تمام در و