توفي في النجف الأشرف في الساعة العاشرة من ليلة السبت الثاني عشر من جمادى الثانية سنة 1313 هج كما ذكره السيد الصدر في ( التكملة ) . ودفن في الصحن الشريف وله مؤلفات عديدة رأيت منها عند العلامة السيد ميرزا علي آغا ابن المجدد الشيرازي ستة مجلدات في أصول الفقه بخطه منها الأدلة العقلية شرع فيه في سنة 1265 والتعادل والترجيح فرغ منه في سنة 1270 ، ومقدمة الواجب ، والصحيح والأعم ، ومجلدان آخران في مسائل مختلفة متفرقة وناقصة غالبا . وفي الفقه مجلدات أخرى منها المياه إلى آخر الوضوء وهو ناقص ، وصلاة الجماعة فرغ منه في سنة 1301 والزكاة فرغ منه في سنة 1295 والخمس فرغ منه في سنة 1296 ، والصيد والذباحة فرغ منه في سنة 1302 ورأيت في ( مكتبة الشيخ علي كاشف الغطاء ) في النجف عشر مجلدات في الفقه من مؤلفاته ، ورأيت عند بعض أحفاده غير القابلين للاستفادة من آثاره ( نتيجة الأنظار ) وهو منظومة في أصول الفقه تبلغ ثمانية آلاف بيت ، ورأيت في ( مكتبة الحاج علي محمد النجفآبادي ) في النجف - وهي التي نقلت إلى حسينية التسترية - ( إيقاظ الراقدين ) في المواعظ رتبه على حروف الهجاء ، وله ( محاسن الآداب ) في نظم ( منية المريد ) للشهيد الثاني رأيته عند الشيخ عبد المولى الطريحي في النجف ، قال فيها :
سميتها ( محاسن الآداب ) * للطالبين من أولي الألباب
حوت لباب ( منية المريد ) * وهو كتاب شيخنا الشهيد
وله ( أشرف المعجزات ) يوجد عند الشيخ مهدي بن الشيخ محمد بن المولى جعفر شرف الدين التستري في تستر ، و ( قبلة الناسك ) في المناسك ، يوجد عند الآغا خليل ابن الشيخ مرتضى بن الشيخ محمد علي بن الشيخ جعفر التستري الواعظ ، وله ( كتاب الطهارة ) من تقريرات درس أستاذه السيد علي ، ورسالة في ترجمة أستاذه السيد المذكور وكراماته ، و ( الاكمال والسلامة في بابي الآفاق والإقامة ) أرجوزة في ثلاثمائة وخمسين بيتا ، و ( البدر الدجى ) أرجوزة في الأصحاب في خمسمائة بيت ، وغير ذلك .