في الإشراف على شؤون المكتبة العامة حتى سنة 1388 ه .
جهوده العلمية :
* * قام الشيخ جعفر فقيه بالاشتراك مع الأستاذ هاشم دفتردار بتأليف كتاب عن توسعة الحرم النبوي الشريف ، وضم الكتاب فصولا عن توسعات المسجد النبوي التاريخية ، والأسباب التي دعت إلى التوسعة السعودية الأولى ، وصدور الأمر الملكي الكريم بذلك ، وعن المسجد النبوي الشريف قبل التوسعة ، ثم عن المسجد النبوي الشريف بعد العمارة ، التي ابتدأها الملك عبد العزيز ، وأتمها الملك سعود ، - رحمهما اللّه - لتصبح المساحة التي انتهت بها توسعة المسجد النبوي الشريف هي 16326 م وتوضح أعمال هذه التوسعة خارطة خاصة بالتوسعة السعودية الأولى ، كما يضم الكتاب فصولا عن مساجد المدينة المنورة وإصلاحها ، وعن المستشفى الذي تم إنشاؤه بالمدينة ، وأطلق عليه اسم : « مستشفى جلالة الملك عبد العزيز » ثم عن مبنى الكلية الإسلامية ، الذي تم تعميره ليصبح مقرا لمدرسة طيبة الثانوية .
وقد رعى خادم الحرمين الشريفين فهد بن عبد العزيز ، رعاه اللّه ، الذي كان عندئذ وزيرا للمعارف ، مهمة استلام مبنى هذا الصرح العلمي .
كما تطرق الكتاب للمشروعات الكثيرة التي تمت في تلك الفترة في بلد المصطفى - صلى اللّه عليه وسلم - ومنها إنشاء خزانات ماء الشرب ، وإنشاء محطة الكهرباء ، وتعبيد طرق المدينة وإنشاء طريق جدة - المدينة ، وإقامة السدود الزراعية العديدة .
كتاب خلاصة الوفاء بأخبار دار المصطفى - صلى اللّه عليه وسلم :
* * وهو أحد مؤلفات مؤرخ المدينة نور الدين علي بن عبد اللّه السمهودي ( 844 - 911 ه ) وقد ألفه المؤلف - كما يذكر الشيخ حمد الجاسر سنة 891 ه ، وقد اختصر فيه كتابه « وفاء الوفاء » في نحو نصفه مع جمع مقاصده . 4
قد طبع الكتاب عدة طبعات ، أولاها في بولاق سنة 1358 ه 5 ثم نجد طبعة أخرى لهذا الكتاب ، وقد أشرف على طباعتها الشيخ جعفر فقيه ، سنة 1367 ه وقامت دار إحياء الكتب العربية بنشره ، كما قام الشيخ جعفر نفسه