في الأخلاق : ديباجة الأخلاق الناصريّة ، خاتمة الأخلاق الناصريّة ، أوصاف الأشراف ، ترجمة الأخلاق الناصريّة .
في التفسير : تفسير سورة الإخلاص والمعوّذتين ، تفسير سورة العصر .
في التاريخ : واقعة بغداد .
في الفقه : جواهر الفرائض ، ويطلق عليه « الفرائض النصيريّة » .
في الفلك : الصبح الكاذب ، التذكرة وهو في علم الفلك .
في الطبّ : تعليقة على قانون ابن سينا .
في التربية والتعليم : آداب المتعلّمين .
في المنطق : أساس الاقتباس ، تجريد المنطق .
في الفلسفة والحكمة : شرح الإشارات ، رسالة في العلم الاكتسابيّ ، الرسالة النصيريّة ، رسالة في إثبات الجوهر المفارق ، إثبات العقل الفعّال ، بقاء النفس بعد دثور البدن .
في علم الكلام : تجريد العقائد ، الفصول النصيريّة ، تلخيص المحصّل ، مصارع المصارع ، رسالة في الجبر والاختيار ، رسالة السير والسلوك ، معرفة النفس ، رسالة في العصمة ، رسالة في أصول الدين ، رسالة في الإمامة .
وفاته :
توفّي المحقّق الطوسيّ في آخر نهار يوم الغدير سنة اثنتين وسبعين وستّمائة ( 672 ) ، وكانت مدّة عمره خمسا وسبعين سنة وسبعة أشهر وسبعة أيّام ، ودفن في مشهد مولانا الكاظم عليه السّلام .
قال المحدّث النوريّ : من الاتّفاقات الحسنة أنّهم لمّا احتفروا الأرض لدفنه فيها وجدوا قبرا مرتّبا مصنوعا لأجل دفن الناصر العبّاسيّ ، ولم يوفّق الناصر للدفن فيه ، ودفنوه في الرّصافة ،