محدّث قمى در الفوائد الرضوية مىفرمايد :
عالم فاضل كامل جامع معقول و منقول . او و برادر بزرگترش آقا جمال در دامان علم متولّد و در سايهء كمال رشد يافتند و نزد پدر خود آقا حسين و دائى خود محقّق سبزوارى تلمذ كردند و بلغا ما بلغا . . . .
علامهء طهرانى در أعلام الشيعة مىگويد :
عالمى فاضل ، متكلّمى شاعر ، و صاحب تأليفاتى است . وى يكى از چند نفرى است كه حكم شاه سلطان حسين دربارهء نهى از منكرات را امضا نمود . يكى از شاگردان او گويد كه در مجلس درس او دويست تا سيصد نفر حاضر مىشدند .
حزين لاهيجى در سفرنامه و ملحقات آن مىنويسد :
فاضل عالى شأن آقا رضى الدين محمّد و خلف علامهء نحرير آقا حسين خوانسارى از اذكياى علما بود . طبعى به غايت دقيق و فكرتى عالى داشت ، در خدمت او بسيارى از فضلاء مستفيد شدند .
مدرّس تبريزى در ريحانة الأدب مىفرمايد :
رضى الدين محمّد بن آقا حسين خوانسارى برادر كهتر آقا جمال خوانسارى كه پيش از او در جوانى وفات يافته و هر دو برادر مسمّى به محمّد بودهاند .
تأليفات و آثار
1 . حاشيهء شرح لمعه .
2 . حاشيهء [ شرح ] حكمت العين .
3 . حاشيه بر حاشيهء خفرى بر الهيات شرح تجريد قوشجى .
4 . ترجمهء نهج الحق علّامهء حلّى قدس سره .
5 . شرح دروس شهيد اوّل . چون شرح دروس پدرش ناقص مانده بود مىخواست آن را تكميل كند و موفّق شد كه كتاب صوم و اعتكاف را بنويسد كه اين كتاب ضميمهء شرح دروس پدرش چاپ شده است .
6 . مائدهء سماويه .