و به درجهء اجتهاد نايل و از اساتيد خود اجازهء اجتهاد و روايت دريافت كرد ، و به اتفاق علامه شيخ محمّد رضا تنكابنى به موطن خود بازگشت و در قزوين از هم جدا شدند . شيخ محمّد رضا به تهران و شيخ محمّد حسين به رامسر رفت ، و « مدرسهء نارنج بن » را تجديد بنا نمود و تا آخر عمر در كنار مدرسه به تدريس و تعليم و قضاى حوائج عامه مشغول بود . تابستانها نيز در جورديه به تدريس اشتغال داشت .
سرانجام در روز سهشنبه 12 / جمادى اول / 1354 ق مطابق با 21 / مرداد / 1314 ش در جورديهء رامسر به رحمت ايزدى پيوست . و برحسب وصيت جسدش را به قم حمل ، و در قبرستان « حاج شيخ » دفن شد .
از تأليفات او
1 - جوامع الكلم ، منظومهاى است در اصول فقه به زبان عربى در مدت يك ساعت و نيم به نظم درآورده ، چنان كه در آخر آن خود بيان مىكند :
قد تمت المنظومة فى سلخ صفر * نرجو من اللّه نجاة من سقر
رقمه الحسين فى حال الالم * ان كان فيه سهو فهو للقلم
نظمتها فى ساعة و نصفها * ذلك فضل اللّه يؤتى من يشا
در تعريف علم ورد بر تعريف علم ميرزا محمّد تنكابنى صاحب قصص العلماء چنين گفته :
و الفاضل التنكابنى قد خبط * خبطا عظيما فاحشا فقد هبط
قد حمل العلم على التصديق * كلامه عار من التحقيق
اين منظومه به همت و هزينهء « منتظم الملك » وزير به طبع رسيد .
2 - العشرة الكاملة ، ده قاعده در اصول فقه به زبان عربى است . نسخهء اصل را منتظم الملك وزير جهت چاپ از شيخ محمّد حسين گرفت ، ولى قبل از شروع به چاپ وفات نمود و كتاب نزد ورثهاش باقى ماند . اكنون نسخهء اصل در دست