وجاء الباب الثالث ، بالرغم من ضياع بعض الورقات الأولى منه ، عرضا شاملا لسبع فرق هي : الروافض - الخوارج - المعتزلة - المرجئة - النجارية - الجهمية - الكرامية - مع اقسام كل فرقة دون التمييز بين اتباع الفرقة والغلاة منهم ، كما ذكرنا سابقا . وموضوع الباب الثالث هنا يقابله البابان الثالث والرابع من كتاب « الفرق بين الفرق » . وقد فصّل البغدادي في هذا الكتاب الأخير الغلاة عن أصحاب الفرق ، وخصص لهم فصلا مستقلا هو الفصل الرابع . وهكذا يكون كتاب « الفرق بين الفرق » أوضح من المخطوطة في تقسيمه للفرق . اما الباب الرابع من المخطوطة ، فعنوانه شبيه بعنوان الباب الخامس من كتاب « الفرق بين الفرق » - وهذا الباب الخامس ناقص في « مختصر كتاب الفرق » للرسعني . ولكن ترتيب الباب الرابع في المخطوطة يختلف عن ترتيب الباب الخامس من كتاب « الفرق » . فإذا كانت المخطوطة مختصرا لكتاب « الفرق » لكان الترتيب متفقا بين الكتاب الأصلي وملخصه كما نلاحظ في « مختصر » الرسعني لكتاب « الفرق » . ولكننا نلاحظ إن في الصفحتين الأولتين ( ص 123 - 124 ) من الباب الرابع من المخطوطة يتساءل المؤلف كيف يمكن اعتبار القدرية والخوارج والروافض والنجارية والبكرية والضرارية من أهل السنة ؟ - اما في كتاب « الفرق » فمثل هذا التساؤل وارد في الفصل الثاني من الباب الخامس ، لا في اوّل هذا الباب . وما اتى في المخطوطة بعد ذلك من الصفحات 125 إلى 127 فقد ورد جزء منه في الفصل الأول ، وجزء منه في الفصل الثالث وجزء في الفصل الخامس وجزء في الفصل السادس من الباب الخامس من كتاب « الفرق بين الفرق » . فكأن الباب الرابع في المخطوطة جاء بمثابة مخطط اولي وسريع للباب الخامس من كتاب « الفرق » كما وان الباب الثالث من المخطوطة جمع في الواقع بابين هما الثالث والرابع من كتاب « الفرق » ؛ مما يدل على أن المخطوطة كانت محاولة أولى في عرض الفرق والملل والنحل ؛ فهي اسبق عهدا من كتاب « الفرق بين الفرق » لا مخلصا له .