آثار قاينى حكيم اكثر آثارى كه از اين حكيم به دست آمده به خط اوست ، و تنها كتابى كه از كتابهاى وى استنساخ شده كتاب الشجرة الطيبة في اثبات الحركة است ، و دو نسخه از اين كتاب ، يكى در كتابخانهء دانشكدهء الهيات و ديگرى در كتابخانهء مدرسهء شهيد مطهرى ( سپهسالار سابق ) ، موجود است ، و ما هر دو را گزارش خواهيم كرد . نه اثر از آثار وى در زير معرفى مىشود كه به استثناى دو اثر ، بقيه در كتابخانه‌هاى مختلف تهران موجود مىباشد : بخش أول - رساله‌هاى فارسى 1 . اسرار الآيات يا مقاله در چگونگى پيدايش غرايب و عجايب و شگفتيهاى گيتى اين مقاله يا كتاب دربارهء خوارق عادات و أمور شگفت انگيز از قبيل معجزات و كرامات و اخبار از مغيبات و كهانت و سحر و جادو و چشم زخم و اسرار تأثير دعا و أمثال آنهاست . مؤلف اين مسائل را از رهگذر فلسفه و عرفان و آيات و اخبار بررسى كرده و در آن از نبوت مجهول أرسطو « 1 » و سخن « نبى كامل و حكيم فاضل زرادشت در كتاب زند » و اسكندر افروديسى و رسالهء فيض الهى ابن سينا و أبو عبد اللّه محمد رازي و ما بعد الطبيعة و فلسفهء اولاى أرسطو ياد كرده است . در باب دوازدهم اين مقاله نامه‌اى است فلسفى از « خردمند فاضل و دانشور كامل محمد المحسن الاصفهانى اندر اثبات علم به احكام نجوم » كه گويا مراد أو معز الدين محمد بن تقى الدين محمد حسينى أصفهاني سابق الذكر باشد كه در التسهيل از أو ياد كرده است . مؤلف در خاتمهء اين مقاله ياد آور مىشود كه بايد آن را بعد از علوم حكمت خواند . اين كتاب در شانزده باب و يك خاتمه به شرح زير مىباشد : باب أول اندر آنكه چگونه برخى از دنيا گذشتگان از خوردن و آشاميدن ، روزگار دراز اعراض نمايند .

--> ( 1 ) مؤلف روايت « ان أرسطو طاليس كان نبيا فجهله قومه » را دربارهء أو در اين مقاله آورده است .