به هم خورد ، بديهي است أو به عنوان خليفه وزمامدار در فكر چاره جوئى از اين نارضايتىها ودر صدد تبرئه خويش بود ، اما در هر حال سر انجام كار به اينجا رسيد كه امام رضا ( عليه السلام ) هم پس از چندى مسموم شد . يك شبانه روز هم قضية را مكتوم نگاه داشتند ، مأمون هم شديدا از اين جريان اظهار تأسف كرد ودستور داد با احترام تمام بدن آن حضرت را در كنار قبر هارون دفن نمايند . آن حضرت در حدود دو سال در شهر مرو ونزديك به هفت ماه در سرخس أقامت داشت ، ماه‌هاى آخر عمر را هم در سناباد طوس به سر بردند ودر همانجا بود كه به شهادت رسيد . شهادت آن حضرت را در روز آخر ماه صفر سال 203 هجرى قمري وعمر ايشان را هنگام شهادت 54 سال و 3 ماه و 19 روز نوشته اند . مدفن آن حضرت قبر امام ( عليه السلام ) در مشهد قرار دارد ، در أوائل اسلام شهري بنام " مشهد " وجود نداشت ، در محل فعلى اين شهر دهكده گمنامى بود كه آن را سناباد گفته وجزء أراضي طوس بود . هارون كه براي رفع اغتشاش واصلاح أوضاع نواحي خراسان به إيران سفر كرده بود ، ودر أثناء سفر بيمار شده واز دنيا رفته بود ، در قصر حميد بن قحطبه كه در اين ناحية قرار داشت به خاك سپرده شد . مدفن امام را هم پس از شهادت ايشان قرار شد در كنار قبر هارون قرار دهند .