اتفاق النسخ ( ك ، ه ، و ) في النهاية بآخر الكتاب وهي ترجمة « أبو الفرج بن القف » وهو ما انتهت به طبعة مولر . - وعلى ضوء هذا الاختلاف والاتفاق ، كان اختياري للأصل الذي اعتمدناه في النسخ ، ثم المقابلة على النسخ الأخرى ، للوصول بنص أقرب ما يكون إلى نسخة المصنف . وقد أشرنا إلى التغيير في الأصل في حينه ، مع إثبات أرقام صفحات الأصل بالهامش بين معقوفتين [ ] . - استخدمنا الطريقة الإملائية الحديثة في الكتابة . وقمت بتصحيح الأخطاء النحوية دون الإشارة إلى ذلك ، مثل كتابة الألف ألفا ولو كانت منقلبة عن ياء ، وإهمال الهمزة آخر الكلمة ورسمها واو إذا كانت مضمومة أو ياء في حالة الكسر مع تخفيف الهمزة وكتابتها ياء . - ما نقص بطريق السهو من الناسخ والذي أكمله في مواضع أخرى ، قمنا باستكماله دون الإشارة إلى ذلك ، كما حذفنا التكرار . - وما عدلنا فيه عن الأصل وضعناه بين حاصرتين [ ] ، وأشرت بالأقواس « إلى ما فيه نقص أو اختلاف عن الأصل بالنسخ الأخرى . وذلك تحريا للأمانة العلمية . - هذا ما اتبعته في ضبط نص الكتاب . ثم قمت بتقسيم الكتاب إلى ثلاثة أجزاء ، اقتداء بما وجد في النسخة الخطية ( ج ) ، حيث جاء بهامش ( ق 70 و ) ما نصه : « أول الجزء الثاني من خط المصنف » . وكما جاء في النسخة التركية ( و ) حيث كتب على صفحة العنوان « السفر الثالث من نسخة كتبت 735 ه . . » . وسيكون التقسيم كالتالى : الجزء الأول : يبدأ بأول الكتاب ، وينتهى بنهاية الباب السابع في « طبقات الأطباء الذين كانوا في أول ظهور الإسلام من أطباء العرب وغيرهم » . الجزء الثاني : يبدأ بأول الباب الثامن في : « طبقات الأطباء السريانيين الذين كانوا في ابتداء ظهور دولة بنى العباس » . وينتهى بنهاية الباب العاشر في : « طبقات الأطباء العراقيين وأطباء الجزيرة وديار بكر » . الجزء الثالث : يبدأ بأول الباب الحادي عشر في : « طبقات الأطباء الذين ظهروا في بلاد العجم » . وينتهى بنهاية الكتاب .