أما في الجهة الجنوبية للمدينة فيظهر جبل عير كأهم المعالم الطبيعية المميزة للمدينة في تلك الجهة ، ويمتد هذا الجبل بطول خمس كيلومترات ونصف تقريبا وعلى بعد ثمانية كيلومتر من المسجد النبوي الشريف ، ويبلغ ارتفاعه حوالي ثلاثمئة متر من منسوب مستوى وادي أبو هريرة الذي يحده من الشرق ، وتتناثر حول هذا الجبل مجموعة من الجبيلات الصغيرة التي تعرف بضليعات القبا ، ويضاف إلى هذه المرتفعات مجموعة كبيرة أخرى من الجبال التي دخلت بالفعل ضمن المنطقة العمرانية للمدينة منذ وقت مبكر وشكلت عائقا وحاجزا طبيعيا ومستمرا وقف إلى حد ما أمام امتداد التطور العمراني . ومن أهم هذه الجبال جبل سلع الذي يقع في الجهة الشمالية الغربية من المسجد النبوي الشريف ، وقد اندمج هذا الجبل تماما مع السكن كجزء من التكوين العام للمدينة وقد عمر هذا الجبل منذ وقت مبكر يرجع إلى عهد النبوة حيث سكنته قبيلتي جهينة وبلى . ولهذا الجبل شعاب وتجاويف ، وتتصل به قرون جبلية صغيرة أهمها جبل سليع وكذلك جبل القرين الفوقاني ، وهو قرن من سلع وفي امتداده الشمالي الشرقي القرين التحتاني . ومن هذه الجبال أيضا جبل ثنية الوداع في شمال المدينة والذي أقيم عليه فيما بعد مسجد ثنية الوداع ، وقد أزيل هذا الجبل ضمن مشروع تحسين مخرج نفق المناخة وتوسعة الميدان مع ملاحظة أن هذه الثنية كانت تسمى قبل مجيء الرسول صلى الله عليه وسلم إلى المدينة بثنية الركاب ، ولم تسمى ثنية الوداع إلا بعد غزوة خيبر وفي رواية بعد غزوة تبوك ، وعلى هذا فإن ما ورد في استقبال أهل المدينة للرسول صلى الله عليه وسلم يوم الهجرة من ثنية الوداع المقصود بها ناحية العقيق مما يلي قباء . ( وسنذكر هذا بالتفصيل عند الحديث عن جبل ثنية الوداع فيما بعد ) . وكذلك جبل الراية الذي أقيم عليه مسجد الراية ويعرف هذا الجبل أيضا بجبل ذباب . ومن الجبال أيضا جبل المستندر وهو جبل أسود صغير يمتد في منطقة الداوودية شمال المدينة ، وقد عمر هذا الجبل منذ عهد الهجرة ، وقد أزيل هذا الجبل ضمن أوائل مراحل التطوير التي شهدتها المدينة المنورة . هذا بالإضافة إلى مجموعة كبيرة من الجبال التي تقع حول المدينة وعلى حدودها ، منها ما هو داخل المدينة اليوم ، ومنها ما هو خارجها ، وسنفرد كل جبل من هذه الجبال بوصف مختصر يبين وصفه وموقعه من المدينة وحدوده . ونظرا لكثرة الجبال التي تميزت بها المدينة المنورة عن غيرها سواء ما هو بداخلها أو حولها أدى إلى انحدار الكثير من الشعاب والشرائع الهابطة من تلك