در فلسفه و رياضيات با اينكه او در زادگاه خود ، در رياضيات ارشاد الحساب و در فلسفه و كلام ، اشارات و كشف المراد را خوانده بود ، ولى ذوق سرشار فلسفى استاد را ، اين دو كتاب اشباع نمىكرد در نجف اشرف او با حكيم بزرگى برخورد مىكند ، كه از فحول فلاسفه و از استادان بس لايق اين دانش بوده يعنى با حكيم و فيلسوف وقت خود سيد حسين بادكوبه‌اى ( رضوان الله عليه ) آشنا مىگردد اين حكيم معروف كه هنوز حتى جامعهء علمى او را به خوبى نشناخته است يكى از متفكران عصر خود بود و او بود كه توانست علامه طباطبائى را با حقيقت فلسفه و عرفان بالاخص تفكر فلسفى آشنا سازد . مرحوم علامه شيخ آغا بزرگ تهرانى در طبقات اعلام الشيعه بگونه يادشده در زير از او ياد كرده است و او را چنين معرفى مىكند : " سيد حسن بن سيد رضا بن سيد موسى بادكوبه‌اى كه در سال 1293 در قريه " خود دلان " ( بادكوبه ) ديده به جهان گشود و فلسفه و عرفان را از حكيمان عصر خود مانند ميرزا هاشم اشكورى ، ميرزا ابو الحسن جلوه ، آقا على مدرس صاحب بدايع الحكم و فقه و اصول را نزد شيخ محمد حسن