. . . تلمذ السيد محمّد في أصفهان عند الشيخ أحمد المجتهد البيدآبادي ، والحكيم جهانگير خان القشقائي ، والآخوند الملا محمّد الكاشاني ، والشيخ عبد الكريم الجزي ، والعلامة الشيخ محمّد رضا النجفي . ثمّ هاجر إلي النجف وحضر أبحاث أعلامها ومنهم : المحقق النائيني ، والآقا ضياء الدين العراقي ، والشيخ محمّد حسين الغروي الكمپاني ، والسيد السيد أبو الحسن الاصفهاني ، حتى نال درجة الاجتهاد وأجيز منهم . قال العلامة الكمپاني في إجازته المؤرخة 1345 : « وبعد ، فإنّ سيد العلماء الأعلام وسند الفقهاء العظام وملاذ الأنام وثقة الإسلام ، السيد السند والمولي المعتمد ، الورع التقي والصفي النقي ، جناب الحاج السيد محمّد المقدّس الاصفهاني ، لازال مؤيداً بالتأييد الربّاني ومسدّداً بالتسديد السبحاني ، ممّن أتعب نفسه الزكية في تحصيل القوة القدسية ، وقد حضر علي مدّة مديدة ، مباحث عديدة ، من المسائل الأصولية والفقهية ، مراعياً للآداب الدينية ومتخلقاً بالأخلاق الإلهية ، إلي أن فاز بالمراد وحاز درجة الاجتهاد . فله دامت إفاضاته التصدّي لاستنباط الأحكام الشرعية عن مداركها » . وقال العلامة النائيني في إجازته : « وممّن تصدّي للطلب والعمل به هو جناب العالم العامل والحبر المهذّب الكامل ، ذو القريحة القويمة والسليقة المستقيمة ، عماد العلماء وصفوة الأتقياء الأذكياء ، الصفي التقي الزكي ، جناب الآغا السيد محمّد المقدّس الأصبهاني ، أدام الله تعالى إفضاله ، وكثر في العلماء العاملين أمثاله . فلقد بذل في هذا السبيل برهةً من عمره ، واشتغل به شطراً من دهره ، معتكفاً بجوار أمير المؤمنين صلّي الله عليه وآله الطاهرين ، ومستمدّاً من الجهابذة الأساطين ، حتّي نال الدرجات العلي وفاز