الدقهلية ، وكان صوفيا وخليفة السيد أحمد البدوي كما في وثيقة مخطوطة عام 1282 ه ، وفيها يذكر مشايخه في الطريقة أولهم عمر الصاوي المالكي الحفناوي .
وصار بعد قليل كبير العلماء في هذا الإقليم وإمام الإفتاء فيه ، والعلم المشار إليه بالبنان ، وقصده الناس من كل جهة وحدب ، وعاش مبجلا بين الناس في وسط بلده وأسرته .
تزوج أربع زوجات وخلف ذرية كبيرة صالحة ، وكان ينفق في حياته بسخاء على أسرته الكبيرة الضخمة .
وأخيرا وبعد جهاد طويل وعمر حافل بجلائل الأمور وعظائم الأعمال توفي عام 1912 الموافق سنة 1330 ه عن ثمانين عاما .
مؤلفاته :
اطلعت على فهرس لمكتبة هذا العالم الكبير المغفور له الشيخ نافع خفاجي بخطه فوجدته قد وضع الكتب في مجموعات كل مجموعة بحسب الفن الذي ألفت فيه ، فعلم الفقه وعلم الحديث وعلم التفسير ، وعلم التاريخ الخ ، وكتب في كل مجموعة ما له من مؤلفات في هذا الباب ، وقد جمعت ما ذكره من مؤلفاته ووضعت لها أرقاما مسلسلة وهي :
1 - الطب لنافع الخفاجي .
2 - رسالة الكيمياء لنافع .
3 - الألغاز لنافع وهو موضوع في « مجموعة الحكم ومجموعة العلم والأمثال والألغاز والمسائل » .
4 - مناسك الحج لنافع .
5 - مسامرات نافع .