ولما استوطن مدينة هراة وتملك بها ملكا وأولد أولادا ، ولقب بشيخ الاسلام ، عظم ذلك على الكرامية ، فقيل إنهم وضعوا عليه من سقاه السم فمات ، ففرحوا بموته ، وكانت وفاته يوم الاثنين وكان عيد الفطر سنة ست وستمائة ( 606 / 1209 ) ، ودفن آخر النهار في الجبل المصاقب لقرية مزدا خان ، وأظهر ذلك ، والحقيقة انه دفن في داره وكان يخشى ان يمثل به العامة لما كان يظن به من الانحلال والخروج عن الدين .
وكانت ولادته في الخامس والعشرين من شهر رمضان سنة اربع وأربعين وقيل ثلاث وأربعين وخمسمائة بالري ( 544 ، 543 / 48 ، 1149 ) .
تصانيفه :
ومن اشهر تصانيفه « محصل أفكار المتقدمين والمتأخرين » ، وخ حكمة الاشراق » ، « وأساس التقديس » . و « لوامع البينات » ، وخ شرح الكليات » . و « شرح الإشارات » و « المحصول » . و « مفاتيح الغيب » . وهو المعروف « بالتفسير الكبير » ، قال ابن خلكان : « جمع فيه كل غريب وهو كبير جدا ، لكنه لم يكمله ، وصنف الشيخ نجم الدين أحمد بن محمد تكملة له وتوفى سنة 727 / 1326 ، وقاضى القضاة شهاب الدين بن خليل الدمشقي كمل ما نقص منه أيضا وتوفى سنة 639 / 1241 » ،
وقال ابن تيمية في شأنه : « فيه كل شيء الا التفسير » ، وفي الحقيقة يشتمل على كل شيء من التفسير ، كما قال النجم الطوفي في كتابه الإكسير في علم التفسير : « ما رأيت في التفاسير اجمع لغالب علم التفسير من القرطبي ومن تفسير الامام فخر الدين الا أنه كثير العيوب - فحدثني شرف الدين النصيبي عن شيخه سراج الدين السرمياحى المغربي انه صنف كتاب الماخذ في مجلدين بيّن فيهما ما في تفسير الفخر من الزيف