في الحكمة والعلوم الفلسفية
1 - كتاب الملخص في الفلسفة ،
2 - كتاب الانارات في شرح الإشارات
3 - المحاكمات ،
4 - لباب الإشارات ، طبع
5 - شرح عيون الحكمة ،
6 - كتاب تعجيز الفلاسفة ، وفي اخبار الحكماء كتاب تهجين تعجيز الفلاسفة بالفارسية ،
7 - كتاب البراهين النهائية بالفارسية ،
8 - كتاب الخلق والبعث ،
9 - مباحث الوجود
10 - مباحث الجدل ،
11 - كتاب المباحث المشرقية ، طبع في مجلدين بحيدرآباد ، بالهند ،
12 - الرسالة الكمالية في الحقائق الإلهية ، بالفارسية ، نقلها تاج الدين محمد بن الأرموي إلى العربي في سنة ( 625 ) خمس وعشرين وستمائة بدمشق ، حققها سيد محمد باقر سبزوارى ، ونشرتها جامعة تهران سنة 1335 ه .
13 - المنطق الكبير
14 - الملخص في الحكمة والمنطق ،
15 - شرح المنطق الملخص ،
16 - رسالة وحدة الوجود ،
17 - كتاب الاخلاق ، أظنه نص كتاب النفس والروح وشرح قواهما ، تحقيق « محمد صغير حسن المعصومى »
18 - طريقة في الخلاف ، ذكر صاحب هدية العارفين باسم « اخلاق فخر الدين » انظر رقم 30 تحت « علم الكلام » الطريقة العلائية في الخلاف ،
19 - المحصول في المنطق
20 - مباحث الحدود ،
21 - محصل أفكار المتقدمين والمتأخرين من الحكماء والمتكلمين ، طبع
22 - رسالة في النفس ،