ورمزنا لها ب « ق » .
3 - مخطوطة مكتبة العلّامة السيّد محمّد عليّ الروضاتي بأصفهان ، ضمن الرسالة اليونسيّة في شرح المقالة التكليفيّة . وهي التي ذكرها العلّامة آقا بزرگ الطهراني في الذريعة ( 25 : 308 ) : « ونسخة أخرى . . . عند السيّد محمّد علي الروضاتي بأصفهان معها الكلمات النافعات » .
وتميزت المقالة ب « قال » واليونسيّة ب « أقول » .
الرسالة الثانية : الباقيات الصالحات
هي شرح مختصر للتسبيحات الأربع : سبحان الله ، والحمد لله ، ولا إله إلّا الله ، والله أكبر . قال الشهيد في آخرها :
« فهذه الكلمات الأربع تشتمل على الأصول الخمسة : التوحيد والعدل والنبوّة والإمامة والمعاد ، فمن حصّلها حصّل الإيمان ، وهي الباقيات الصالحات » .
ولأهمّيّة الرسالة قام بشرحها العلّامة البياضي وسمّاها باسم : الكلمات النافعات في شرح الباقيات الصالحات وسوف نعرّفها إن شاء الله .
ومن مخطوطاتها : 1 - مخطوطة مكتبة الفاضل المعاصر فخر الدين النصيري الخاصّة ، ضمن مجموعة من رسائل الشيخ المفيد والسيّد المرتضى ، عليها علامة تملّك حفيد الشهيد شرف الدين محمّد مكّي بأصفهان عام 1169 ه ، جاء في أوّلها :
ما نقل عن مولانا الشيخ العالم العامل الفاضل المحقّق المدقّق ، شيخ الملّة والحقّ والدين ، السعيد الشهيد أبي عبد الله محمّد بن مكّي ، رحمة الله عليه ورضوانه ، وحشره مع من تولاه وحشرنا في زمرتهم بحقّ محمّد وآله الطاهرين في تفسير الباقيات الصالحات .
2 - مخطوطة مكتبة آية الله المرعشي النجفي رحمه الله ، المرقّمة 7 / 3694 ، لم تذكر في فهرسها . نسخت عام 1056 ه ظاهرا .