بمذاكرات با سفير انگليس مشغول بود تا آنكه در آخر كار در تاريخ هفتم رجب 1273 معاهدهء پاريس بين او و سفير انگليس انعقاد يافت و قرار شد كه انگليسها بنادر و جزاير ايران را خالى كنند و ايران نيز سپاه خود را از هرات و افغانستان بيرون ببرد و استقلال آنها را بشناسد و بعدها از هرگونه ادعائى نسبت به آنها صرف نظر كند و در حل اختلافاتى كه بين ايران و افغانستان بروز نمايد ايران بايد بحكميت انگليس راضى گردد .
معاهدهء پاريس كه بموجب آن افغانستان به كلى از تحت تبعيت ايران خارج گرديد و دولت ايران را بعذرخواهى از سفير انگليس واداشت باعث افزايش نفوذ اين دولت در دربار طهران شد و اعتماد الدوله با خوشى تمام شرايط آن را پذيرفت زيرا كه از بدتر از آن ميترسيد و خدا را شكر كرد كه ديگر انگليسها در عزل او اصرارى ندارند اما دولت او پس از ختم جنگ با انگليس چندان مدتى دوام نكرد چه ناصر الدين شاه كه از اختلال امور در عهد صدارت اعتماد الدوله كاملا آگاه شده بود در محرم 1275 او را از صدارت انداخت و شخصا زمام امور را در دست گرفت و امر داد كه بتقليد ممالك فرنك چند وزارتخانه در ايران تاسيس شود مثل وزارت خارجه ، وزارت ماليه ، وزارت داخله ، وزارت جنگ ، وزارت وظايف و وزارت علوم . وزارت ماليه را بعهدهء ميرزا يوسف مستوفى الممالك آشتيانى كه اعتماد - الدوله او را بآشتيان تبعيد كرده بود سپرد وزارت علوم را بعليقلى ميرزا اعتماد السلطنه و وزارت جنگ را هم بميرزا محمد خان قاجار كه لقب سپهسالار يافت واگذاشت و اين حال تا سال 1281 تاريخ صدارت ميرزا محمد خان قاجار باقى بود .
جنگ سرخس در 1271 و مرو در 1276
پيش از لشكركشى بهرات و حكومت مجدد حسام السلطنه بر خراسان يعنى در 1271 و زمان حكومت فريدون ميرزا فرمانفرما والى خوارزم محمد امين خان كه سابقا نيز از حسام السلطنه شكستى يافته بود بار ديگر بحدود مرو آمد و بتعرض خراسان مشغول شد و تا حدود سرخس پيشآمد . فريدون ميرزا بجلوى او