در اصفهان وفات كرده . و در تخت فولاد در مقبرهء بابا ركن الدّين مدفون گشته .
و پسرش مير معصوم است كه در سنهء هزار و صد و پنجاه و شش وفات كرده و در تخت فولاد در نزديكى تكيهء محقّق خوانسارى در جلو قبر مرحوم خلد مقام آقا محمّد بيدآبادى مدفون گشته و معروف است به كرامات و محلّ نذور خلق است .
گويند آقا محمّد وصيّت كرده بود كه نزد او دفنش كنند .
و فرزند ديگر مير محمّد باقر ، مير محمّد اسماعيل است كه عالم عامل ، فاضل كامل ، زاهد تارك دنيا بوده و در علم فقه و حديث و تفسير و كلام و حكمت و غيرها ماهر بوده ، و در جامع جديد عبّاسى در اصفهان مدرّس بوده ، و قريب پنجاه سال تدريس مىكرده و اخذ علم از مولى محمّد تقى مجلسى و ميرزا رفيع الدّين نايينى و سيّد ميرزا جزايرى نموده و هشتاد و پنج سال عمر نموده و در روز دوشنبه شانزدهم ربيع الثانى سنهء يك هزار و سى و يك متولّد شد و در سنهء يك هزار و يك صد و شانزده وفات فرموده .
و از رسالهء اجازات سيّد نور الدّين بن سيّد نعمت اللّه جزايرى - عليهما الرّحمة - نقل شده كه در حال اين سيّد جليل نگاشته كه در سنّ هفتاد سالگى عزلت از خلق اختيار كرده در مدرسهء تخت فولاد كه از بناى خود ايشان است سكنى نموده و قبر خود را در حجرهاى از حجرات كنده و شبها بعد از فريضهء مغرب و عشاء در ميان آن قبر رفته و تهجّد در قبر گذاشته و بعد از آن از قبر بيرون مىآمد و شرح بر اصول كافى و تفسير قرآن مىنوشته ، و روزها جمعى از طلّاب مستعد كه از جمله مرحوم والدم سيّد نعمت اللّه بوده در خدمت ايشان بودند . عاقبت در همان جا وفات فرمود و در همان قبر مدفون شد و بعد از فوت ايشان شاه سلطان حسين حجره را بزرگ كرده و قبّه براى او ساخت كه الآن در تخت فولاد موجود است .
و مير محمّد اسماعيل مذكور را چند فرزند بوده از جمله مير محمّد باقر ملّا باشى كه فاضل كامل متبحّر در فنون علم صاحب مؤلّفات بوده از جمله ترجمهء مكارم الأخلاق . اخذ علم كرده بود از والد ماجدش و از محقّق خوانسارى ، و در مدرسهء
منتهى الآمال في تواريخ النبي و الآل ( فارسي ) — صفحة 1251
مساهمون: الشيخ عباس القمي
ص١٢٥١