راهى اصفهان شد و پس از دو سال اقامت در آنجا به نجف رهسپار گرديد .
در نجف باآنكه خود مجتهد بود ، با شور و شوق در درس آخوند خراسانى حاضر مىشد . اقامت ايشان در نجف هفت سال طول كشيد و طى ان توانست در دو دوره كامل درس خارج اصول آخوند شركت كند كه نتيجه ان يك دوره شرح بر كتاب « كفايهء الاصول » شد كه به قلم ايشان نگارش يافت .
ايشان در نجف در درس ايت اللّه شيخ فتح اللّه شريعت ( شيخ الشريعة ) و ايت اللّه ميرزا محمد حسن خليلى نيز شركت مىنمود .
پس از رحلت آخوند خراسانى ، ميرزا راهى سامرا شد تا از محضر ايت اللّه العظمى ميرزا محمد تقى شيرازى استفاده كند . البته پس از درس استاد ، در جايگاه تدريس مىنشست و بسيارى از شاگردان استاد در كلاس او شركت مىكردند .
البته خود ميرزاى شيرازى نيز به ايت اللّه شاهآبادى توجه ويژهاى داشت .
به همين دليل ، ايت اللّه شاهآبادى يكى از شش نفرى است كه از ميرزاى شيرازى اجازه اجتهاد دريافت كرده است . البته آيات عظام شيخ الشريعة اصفهانى ، سيد اسماعيل صدر ، شريانى ، ميرزا خليل تهرانى هم به عارف كامل شاهآبادى گواهى اجتهاد داده بودند .
البته بايد توجه داشت كه تمام تحصيلات مرحوم شاهآبادى به علوم متداول حوزههاى علميه ان روزگار محدود و منحصر نيست و جالب است بدانيم كه ايشان رياضيات هم خوانده بود و معلم درس رياضيات وى آقا ميرزا عبد الرزاق سرتيپ بود . به علاوه ، از علوم و دانشهايى نظير رمل ، جفر ، و اسطرلاب نيز اطلاع داشت . به طورى كه حتى افراد انگشت شمارى كه از اين علوم سر در مىآوردند ، در صورت مواجه شدن با مشكل ، به مرحوم شاهآبادى مراجعه مىنمودند .
مهمترين استادان ايشان عبارتند از :
1 . پدرش ، شيخ محمّد جواد شاهآبادى
2 . برادرش ، شيخ احمد شاهآبادى
رشحات البحار ( فارسى ) — صفحة 242
مساهمون: محمد على شاه آبادى
ص٢٤٢