1 - إنه كان مرتباً على حسب النزول .
فنتج عن ذلك ان :
2 - قدّم فيه المنسوخ على الناسخ .
3 - كتب فيه تأويل بعض الآيات بالتفصيل .
4 - كتب فيه تفسير بعض الآيات بالتفصيل ، على حقيقة تنزيله . ولعله كتب فيه التفاسير المنزلة تفسيراً من قبل الله سبحانه على حد الأحاديث القدسية .
5 - فيه المحكم والمتشابه .
6 - لم يسقط منه حرف ألف ، ولا لام . ولم يزد فيه حرف ، ولم يسقط منه حرف .
7 - فيه أسماء أهل الحق والباطل .
8 - كان بإملاء رسول الله « صلى الله عليه وآله » وخط عليّ « عليه السلام » .
9 - كان فيه فضائح القوم - أعني : المهاجرين والأنصار - من الشخصيات التي لم تتفاعل مع الإسلام ، كما يجب . ومنه ذِكر المنافقين بأسمائهم ونحو ذلك .
أمران لا بدّ من التنبيه عليهما :
الأول : إن ما ذكر من خصائص وميزات في مصحف عليّ « عليه السلام » ، يوضح لنا السر في صعوبة تعلمه في زمن ظهور الحجة « عليه السلام » ؛ فقد روي عن أبي جعفر « عليه السلام » ، قوله :