ترديد از مهمترين تأليفات او تفسير الميزان است كه جايگاه بسيار مهمى در ميان تفاسير جهان اسلام به خود اختصاص داده و در نوع خود كم نظير و مايهء افتخار شيعه است .
تفسير از آغاز تدوين تاكنون به تحولى اساسى نياز داشت تا هم پاسخگوى نيازهاى اين عصر باشد و هم ديدگاههاى گذشتگان را باز گويد . شيوهء تفاسير از زمان طبرى و تبيان شيخ طوسى تغيير چندانى نيافته بود . در قرن چهاردهم تفسيرهايى مانند المنار از نظر روش بحث و سبك پردازش با تفاسير سنتى تفاوتهايى داشت ؛ اما ابعاد مختلف را در بر نمىگرفت ؛ ولى تفسير الميزان هم در روش بديع است و هم از نظر قوت علمى ، تحليل و استدلالهاى معقول و منطبق با موازين علمى و تنوع مطالب ، در نوع خود بىنظير مىباشد . از مهمترين ويژگى الميزان روش تفسير قرآن به قرآن است كه به گونهاى جامع اين روش در آن اجرا شده . افزون بر آن ، به روش اجتهادى نيز ديدگاهها را مورد نقد و بررسى قرار مىدهد و با ادله مختلف ديدگاه منتخب خود را اثبات مىكند .
علامه طباطبائى رحمه اللّه كتابى در مباحث قرآن پژوهى با نام قرآن در اسلام دارد كه برخى از ديدگاههاى خود در مباحث علوم قرآنى را در آن آورده است .
ترجمه الميزان
اين تفسير دو بار ترجمه شده : يك بار به صورت ناقص كه برخى از جلدهاى آن را ( پنج جلد ) دانشمندانى از جمله آيت اللّه مكارم شيرازى ، مصباح يزدى ، گرامى ، محمد جواد حجتى و . . . ترجمه كردهاند . بار ديگر جناب سيد محمد باقر موسوى همدانى آن را به طور كامل ترجمه كرد . تفسير الميزان افزون بر زبان فارسى به زبان انگليسى و اردو نيز ترجمه شده است .