نيست . وى در اين راه مجاهدتهاى فراوانى از خود بروز داد ، و در بهطور كلى در چهار بخش فعاليتهاى ضد استعمارى خود را به منصه ظهور رسانيد :
الف : مبارزه با سلاطين مستبد قاجار .
ب : مبارزه با ظلّ السلطان حاكم مستبد و مقتدر اصفهان .
ج : مبارزه با اقبال الدوله كاشى حاكم محمد على شاه كه منجر به جنگ مسلحانه شهرى و نهايتا شكست حاكم شد .
د : مبارزه با بعضى حكام مستبد بعد از مشروطه دوم كه عمدتا از سران بختيارى بودند .
6 . مبارزه با بدعتها
از بدعتهايى كه در زمان مرحوم آقا نجفى اوج گرفت انديشه بابيت و بهائيت بود . اين دو فرقه در آن زمان به واسطه جوّ موجود و حمايتى كه از سوى دولتهاى استعمارى مىشدند ظهور و بروز خاصى پيدا كرده و افراد زيادى به جرگه اين دو گروه پيوسته بودند .
مرحوم آقا نجفى بهواسطه احساس مسئوليتى كه مىنمود و به واسطه غيرتى كه خاص خودش بود بر ضد آنان قيام نموده و در دو جبهه عقيدتى و اجتماعى آنان را مورد تاختوتاز قرار داد ، و با صدور فتوا و اعلاميه و نيز اقدامات عملى فراوانى كه انجام داد به مقابله با آنان برخاست . به همين جهت اعضاى اين دو فرقه به تعرضات قلمى و تهمتهاى فراوان به وى پرداختند كه از آن جمله مىتوان به نوشته « لوح ابن الذئب » كه توسط « حسين على بهاء » رئيس بهائيان خطاب به مرحوم آقا نجفى نوشته شده ، و كتاب « رؤياى صادقه » اشاره كرد .
همين برخوردها و اقدامات آقا نجفى بود كه بر انگليس و روس گران آمده و زمينه تبعيد وى از اصفهان توسط ناصر الدين شاه و مظفر الدين شاه را فراهم آورد .