آقاى بجنوردى رضوان اللّه تعالى عليه با مرحوم سيد اصفهانى مباحثهاى مفصّل كردهاند به طورى كه مورد توجّه و عنايت مخصوص مرحوم آقاى اصفهانى مرجع بزرگ آن عصر واقع شدهاند .
نوآورى فكرى آن بزرگ مرد
مرحوم آية اللّه العظمى آقاى گلپايگانى داراى فكرى باز و نظرى بلند و انديشهاى متعالى و پويا بود و در سايهء اين تعالى فكرى و عمق نظر در مدّت سى و دو سال مرجعيّت عامّه خود حوزه را به سمت ترقى و تعالى برد و نوآورىهائى از خويشتن در ادارهء حوزه و هدايت و اعتلاء اين مركز عظيم علمى و ساير مراكز علمى از خويشتن نشان داد كه ما در اين مختصر به چند مورد از نوآوريهاى فكرى آن مرج بزرگ اشاره مىكنيم .
1 - نظم و انضباط را او به حوزه آورد زيرا تا قبل از ايشان هركس وارد حوزه ميشد واگذار به خود بود تا چه پيش آيد و به كجا برسد و آيا موفقيتى را بدست بياورد يا در وسط راه بماند ولى اين مرجع بزرگ و نامآور و اين شخصيت جهانى اولا امتحان را به صورت جدّى در سطح حوزه برقرار نمود و مدارج تحصيلى را به سهپايه درجهبندى فرمود . و شهريهها را براساس مراحل تحصيلى قرار داد و براى بهترين و موفقترين آنان و كسانى كه ممتاز بودند جوائز ويژه مقرّر فرمود .
و ثانيا مدارسى را تأسيس فرمودند كه تحت برنامهء خاص فعاليت ميكرد و كسانى كه در آن مدارس نامنويسى مىكردند ناچار بودند كه خود را با برنامه آن وفق بدهند و تطبيق نمايند در اين مدارس درسها با برنامهريزى ويژه خوانده ميشد و علاوه بر امتحان سالانه امتحان ماهانه نيز داشتند و شهريهء مخصوص به آنها ميدادند و از جملهء مدارس مزبور مدرسهء الامام المهدى عجل اللّه تعالى فرجه الشريف در خيابان صفائيه است .