* فساد الشرط ضمن العقد . في شرط الضمان ، لو ظهر المبيع مستحقاً للغير .
* شرح الأسماء الحسنى .
* كتاب الطهارة . وهو غير شرحه على الوافي المذكور سابقاً ، توجد نسخته في مكتبة السيد المرعشي العامة بقم .
* الفقه الاستدلالي . الظاهر أنه نفس كتابه الاستدلالي في الطهارة وليس كتاباً غيره ، وقد صرح بعض أنه لم يخرج من المسودة وذكر أنه كتاب كبير جداً .
* فوائد الأمة في ردّ شياطين الكفرة . هو للشيخ محمد تقي المعروف بآقا نجفي الأصبهاني ، ونسبوه إلى صاحب الترجمة اشتباهاً .
* مسألة الظنون . ذكرها كذلك تلميذه السيد الخوانساري وقال إنه مستخرج من كتاب الهداية ، ولعلها هي رسالته « حجية المظنة » .
* هداية المسترشدين في شرح معالم الدين . وهو شرح أو حاشية موسَّعة على قسم أصول الفقه من كتاب « معالم الدين » للشيخ حسن بن زينالدين العاملي ، وقد اشتهر في الحوزات العلمية الشيعية وتلقاه العلماء بعين الإكبار منذ تأليفه . طبع مكرراً ، وأحسن طبعاته الطبعة الأخيرة في ثلاثة أجزاء في قم سنة 1420 - 1421 بتحقيق مؤسسة النشر الاسلامي لجماعة المدرسين .
وفاته :
توفي شيخنا صاحب الترجمة وقت الزوال من يوم الجمعة منتصف شهر شوال سنة 1248 بأصبهان ، وصلى عليه الشيخ محمد إبراهيم الكرباسي أو السيد محمد باقر حجة الاسلام الشفتي ، واقتدى في الصلاة عليه جماعة كبيرة من العلماء وبقية الناس .
دفن في المقبرة المعروفة ب « تخت فولاد » وأقبر في « بقعة مادر شاهزاده » التي عُرفت بعد ذلك عند بعض المؤرخين « بقعة الشيخ محمد تقي » .
أبّنه جماعة من الأدباء ورثاه جملة من الشعراء وأرخوا وفاته بالعربية والفارسية ، منها قصيدة تلميذه ميرزا محمد باقر الخوانساري التي يقول فيها :
يا للذي أضحى تقياً نهتدي * بهداه كالبدر المنير الأوقدِ
أسفاً لفقد إمامنا الحَبْر الذي * حتى الزمان لمثله لم نفقدِ