وأمّا آثاره العلمية ، فأهمها :
للسيد المهدي آثار ومؤلفات مذكورة في فهارس اعلام الشيعة ، وقد ذكروا في آثاره العلميّة :
1 - اجتماع الأمر والنهي ، والقول بامتناعه :
يوجد نسخة منه في مكتبة راجة محمد مهدي فيض آباد ، كما في فهرسها ( الذريعة 1 : 269 ) .
2 - أجوبة عن مسائل الحج :
ذكره السيد الأمين في أعيان الشيعة 10 : 160 ، ولم نقف على غيره ، نعم قد أورد السيد بحرالعلوم في كتابه المصابيح بحوث مفصلة تتعلق بالحج في ضمن 15 مصباحاً ، فراجع مصابيح الأحكام 162 - / 170 .
3 - أصالة البراءة :
أوله : « قاعدة : في أنّ الأجزاء والشرائط المحتملة ، ما لم يقم دليل عليها نفياً أو إثباتاً ، الأصل فيها البراءة أو الاشتغال ؟ وتنقيح المسألة برسم مباحث ، الأوّل :
لا ريب أنّ محل إجراء البراءة . . . » ( الذريعة 2 : 116 ) .
4 - تحفة الكرام في تاريخ مكة والمسجد الحرام :
وهو هذا الكتاب الذي نقدّم له ، ذكره من جملة مصنفاته أكثر من ترجم له وسيأتي الحديث عنه مفصّلًا تحت عنوان ( توثيق الكتاب ) .
5 - تقرير بحوثه :
في مقدمة الرجال : « وأما تقريرات تلاميذه فهي كثيرة » كما جاء في مقدمة رجال السيد بحرالعلوم ( 1 : 95 ) ، وقد وقفنا على تقريرين له ، هما :
أ - تقريرات تلميذه الجليل الحجة صاحب مفتاح الكرامة في الفقه ، وفي أعيان