وفات و مدفن
سرانجام اين عالم بزرگوار پس از 96 سال عمر با عزت و عزلت ، براثر كسالت در اولين ساعات بامداد روز شنبه 27 / ربيع الثانى / 1405 ق مطابق با 29 / دى / 1363 ش در پى بيمارى نداى حق را لبيك گفت ، و به ديار باقى شتافت . ارتحالش عالم اسلام و حوزههاى علميه را عزادار ساخت .
شيخ محمّد على خوانسارى
مردم مسلمان تهران كه از ارتحال اين عالم جليل القدر اطلاع حاصل كردند ، اطراف بيت ايشان اجتماع كرده ، و به سينهزنى و عزادارى پرداختند . سپس با احترام فراوان و شركت گسترده در تشييع ، پيكر پاكش ، جهت خاكسپارى به شهر قم انتقال يافت و بعد از تشييعى كمنظير ، با شركت مراجع تقليد و علما و طلاب حوزهء علميه و كليهء طبقات ( كه حقير شاهد و ناظر آن تشييع عظيم بودم ) ، حضرت آيتاللّه گلپايگانى بر جنازهاش نماز گزارد ، و در حرم حضرت فاطمهء معصومه عليها السّلام به خاك سپرده شد .
سيد احمد خوانسارى افتخار دامادى آيتاللّه شيخ محمّد على خوانسارى - كه از مشاهير علما و بزرگان و ساكن نجف اشرف بود - را داشت . فرزندانش عبارتند از : 1 - سيد جعفر خوانسارى 2 - سيد فضل اللّه احمدى ، متوفاى اواسط / ربيع الثانى / 1401 ق 3 - سيد مسعود احمدى 4 - سيد جواد ناسوتى 5 - سيد على احمدى ،