4 - شرح كتاب التبصرة .
ثانيا : الطب والكيمياء
1 - حاشية على كتاب الجفر للسيد حسين العقيلي الهندي .
2 - حواشي على سرخاب القوندي في الرمل .
3 - رسالة في الجدري .
4 - رسالة في الوباء والطاعون ، وقد طبعت .
5 - رسالة في الزبر والبينات .
6 - شرح كتاب الكيمياء لأبي بكر الرازي .
ثالثا : الحساب والمنطق
1 - حواشي على خلاصة الحساب .
2 - حواشي على شرح الأسباب .
3 - شرح على التجريد .
رابعا : الأدب والرجال
1 - حواشي على الرجال الكبير .
2 - ذيل على كتاب السلافة للسيد محمد معصوم .
3 - رجال السيد علي بن السيد محمد الحسيني الحكيم .
وللسيد علي الحكيم كتاب " حواشي على كليات التفسير " . وبعد هذا الجهد العلمي الكبير توفى عام 1300 ه ، ودفن في وادي السلام بالقرب من مقام الإمام المهدي عليه السلام .
2 - السيد مهدي بن السيد علي الحكيم
كان السيد مهدي بن السيد علي بن السيد محمد الحكيم عالما فقيها ، ومن المرجوع إليه مع أبيه عام 1240 ه ، كما في إشارة على ظهر نسخة من كتاب " إثبات الهداة " « 1 » . ولكن المصادر لم تشر إلى نتاجه العلمي .
هامش
( 1 ) الطهراني : طبقات أعلام الشيعة / الكرام البررة 2 / ق 2 / 825 - 826 .