وقيل : 118 سنة توفّي في التيه الذي أصاب بني إسرائيل بجبل هور في طور سيناء ، ودفنه موسى عليه السّلام بها ، وقيل : دفن في جبل مران ، وقيل : في جبل وموات .
وكانت وفاة موسى عليه السّلام بعده بثلاث سنين .
نقل عن الإمام الصادق عليه السّلام أنّه قال : « موسى عليه السّلام وهارون عليه السّلام ذهبا إلى جبل طور سيناء ، وعند الجبل مرّا على بيت أمامه شجرة معلّقة عليها قطعتا لباس ، فأمر موسى عليه السّلام ، هارون عليه السّلام أن يخلع ملابسه ويلبس ما على الشجرة ، ففعل هارون عليه السّلام ذلك ، ثمّ طلب موسى عليه السّلام منه الدخول إلى داخل ذلك البيت والنوم على سرير كان داخل الدار ، فدخل الدار ونام على السرير ، فأتاه ملك الموت وقبض روحه .
فلمّا رجع موسى عليه السّلام إلى قومه أخبرهم بموت هارون عليه السّلام فكذّبوه واتّهموه بقتله ، فطلب من اللّه أن يبرّئه ممّا اتّهموه به ، فأرسل اللّه عددا من الملائكة حاملين جثمان هارون عليه السّلام على تابوت في الهواء ، فلمّا شاهد الإسرائيليّون جثمانه صدّقوا موسى عليه السّلام في موت أخيه » .
القرآن المجيد وهارون بن عمران عليه السّلام
وَعِيسى وَأَيُّوبَ وَيُونُسَ وَهارُونَ . . .
النساء 163 .
وَأَيُّوبَ وَيُوسُفَ وَمُوسى وَهارُونَ . . .
الأنعام 84 .
رَبِّ مُوسى وَهارُونَ
الأعراف 122 .
وَقالَ مُوسى لِأَخِيهِ هارُونَ . . .
الأعراف 142 .
وَأَخَذَ بِرَأْسِ أَخِيهِ يَجُرُّهُ . . .
الأعراف 150 .
قالَ رَبِّ اغْفِرْ لِي وَلِأَخِي وَأَدْخِلْنا فِي رَحْمَتِكَ . . .
الأعراف 151 .
ثُمَّ بَعَثْنا مِنْ بَعْدِهِمْ مُوسى وَهارُونَ . . .
يونس 75 .
وَأَوْحَيْنا إِلى مُوسى وَأَخِيهِ . . .
يونس 87 .
قالَ قَدْ أُجِيبَتْ دَعْوَتُكُما فَاسْتَقِيما . . .
يونس 89 .
وَوَهَبْنا لَهُ مِنْ رَحْمَتِنا أَخاهُ هارُونَ . . .
مريم 53 .