تخرج بالآيات القرآنية عن معانيها اللغوية ومدلولاتها الشرعية ، وهي التي وصفها بالبعث كما قدمنا . أما الفئة الثالثة ، فئة التوسط بين جانبي الإفراط والتفريط ، فهي لم تتجمد جمود الفئة الأولى ، ولم تتهور تهور الفئة الثانية ، وهذه الفئة قامت بما يلي :
1 ) أخذت الآيات التي لها مساس بالعلوم وفهمتها بناء على ضوء المعارف الحديثة اليقينية لا الظنية ، وفي نطاق قوانين الشرع العامة وقواعد اللغة الثابتة ، فرأت فيها كل ما يدل كل ذي عقل على أن هذا القرآن ليس من عند البشر وإنما من عند اللّه .
2 ) وقفت عند ظاهرة النص القرآني إذا كانت دلالته قطعية ، وإن كان يتعارض مع بعض النظريات العلمية الرائجة ، جازمة بأن الخطأ في النظرية العلمية ، وأن على أصحابها أن يبحثوا عن وجه الصواب في موضوعها مستندة على أن العلم لا يتناقض مع الدين ، أو القرآن مع القوانين اليقينية الثابتة .
هكذا ، يعرض الدكتور محمد حسن هيتو منهجه في الإعجاز القرآني في كتابه « المعجزة القرآنية » ، متسلّحا بكل الضوابط التي وضعها العلماء ، فكان كتابه خير نموذج للتفسير العلمي للقرآن ، حيث فسّر فيه اثني وعشرين آية قرآنية بضوء مفردات العلم الحديث ، كما أنه رد على مفهوم الإعجاز العددي في القرآن ، كما ورد عن رشاد خليفة ، وربطه بالتفسير الباطني اليهودي ، فهو يرفض أن يضع في القرآن ما ليس فيه بحجة التفسير العلمي ، كما فعل رشاد خليفة . إن كتاب « المعجزة القرآنية » هو خير نموذج للتفسير العلمي للقرآن ، مبدأ ومنهجا وتطبيقا ، وبمقدار ما نقرأ فيه من علوم ومعارف نجد فيه وظيفة القرآن في الدعوة والإرشاد والهداية متحققة ، فلا نضيع وسط معلومات عن أنظمة الخلق والمخلوقات وننسى رب الخلق ورب المخلوقات وأنظمتها وقوانينها .
وإذا ما أخذنا نموذجا تطبيقيا لمنهج الدكتور محمد حسن هيتو ، فإننا سنرى مقدار وضوح الإعجاز العلمي في الآيات القرآنية التي يختارها منه . ففي تفسيره العلمي للآية الثامنة عشرة ، والتي وضعها تحت عنوان
وَمِنْ كُلِّ شَيْءٍ خَلَقْنا زَوْجَيْنِ لَعَلَّكُمْ تَذَكَّرُونَ
[ الذاريات / 49 ] وشعار ( علماء الكون والحياة في قانون الزوجية اليقيني ) يقول : « لقد تكرر ذكر الأزواج في القرآن الكريم من أوله إلى آخره مرات كثيرة ، وفي جوانب متعددة من جوانب الحياة ، بل نصت بعض الآيات على أن كل شيء خلق في هذا الكون خلق على قانون الزوجية ، فقال تعالى
وَتَرَى الْأَرْضَ هامِدَةً فَإِذا أَنْزَلْنا عَلَيْهَا الْماءَ اهْتَزَّتْ وَرَبَتْ وَأَنْبَتَتْ مِنْ كُلِّ زَوْجٍ بَهِيجٍ
[ الحج / 5 ] ، وقال تعالى