التنقل منهم إلى جهات عديدة وانتهى الأمر بعد حروب إلى أسر الإمام المهدي وجماعة من أصحابه سنة 794 ثم سجن في قصر صنعاء مدة سبع سنين وأشهر وفيها الف متن ( الأزهار ) وشرحه بالغيث ووصل إلى كتاب البيع وقد نقم العلماء الأعلام على علي بن صلاح في تعديه على الإمام المهدي بالحبس وقد نصحه العلماء بتخليته لعلو رتبته في العلم والفضل وسبقه بالدعوة ومبايعة العلماء له فلم يقبل حتى كتب له السيد العلامة الهادي بن إبراهيم الوزير قصيدة قال فيها في آخرها : وان السيد المهدي منكم * بمنزلة تحق له الفخامه ألم يك جدك المهدى خالا * له وكفى بذلك من رحامه نصيحة وامق خدن شفيق * محب ليس يحتاج القسامة فاني والحديث ذو شجون * وليس يليق في الدين الحشامه أخاف إذا استمر القيد فيه * تجىء مقيدا يوم القيامة فيسئلك الاله بأي ذنب * تقيده وتحبسه ظلامه ولا تسمع إلى من قال فيه * بترك القيد واطرح الملامه وله كرامات يطول ذكرها وببركته صلح أهل الحبس أجمع وحفظوا القرآن عن ظهر قلب وحفظوا مسائل العلم . وجلالته