المؤتمر انتزع الشيخ الظواهري قرارا أعلن فيه ( وحدة مصر والسودان ) ولما علم عبد الخالق ثروت بذلك قال ( لم أكن أعلم أن الأزهر يخرج سفراء في السياسة ) . وتولى مشيخة الأزهر سنة 1929 م وسار على منهجه الذي أوضحه في كتابه ( العلم والعلماء ) وكان متأثرا بفلسفة الشيخ محمد عبده والإمام المراغي في السير نحو الإصلاح الديني وخطا خطوة عظيمة في اصدار القانون سنة 1930 م وبمقتضاه . - انشاء كلية الشريعة لتخريج علماء يتولون الافتاء والقضاء الشرعي . - إنشاء كلية لأصول الدين لتخريج مدرسي الدين في الأزهر والمعاهد الدينية وكلية اللغة العربية لتخريج مدرسين للغة العربية . - كما اهتم بالدراسات العليا فأنشأ ( تخصص الدعوة والإرشاد ) ( تخصص المادة للتدريس ) . - وأصدر ( مجلة الأزهر ) التي كانت تعرف قديما ( بنور الإسلام ) لتعبر عن الأزهر وتنشر الثقافة الدينية ( وهي الآن تصدر بالعربية والإنجليزية ) . - وكان رحمه اللّه متواضعا . . لما ناداه العلماء ( بالإمام الأكبر ) قال ( ما أنا إلا واحد من المشايخ ) وقرأ ( إن أكرمكم عند اللّه أتقاكم ) . ومن مؤلفاته : 1 - العلم والعلماء ( سبقت الإشارة إليه ) . 2 - رسالة الأخلاق الكبرى . 3 - خواص المعقولات في أول المنطق وسائر العقليات . 5 - الوصايا والآداب . 6 - صفوة الأساليب . 7 - حكم الحكماء . 8 - براءة الإسلام من أوهام العوام .