أبو نصر فارابى وابن سينا دو چهرهء ممتاز در انديشه‌هاى فلسفي چنان چهره‌اى زشت يافتند كه ننگ زمان ونحسى دوران به شمار آمدند : قد ظهرت في عصرنا فرقة * ظهورها شؤم على العصر لا تقتدى في الدّين إلّا بما * سنّ ابن سينا وأبو نصر دانشمندان أهل سنّت وجماعت فلسفهء يونان را مقابل با قرآن قرار دادند وكتابهايى همچون ترجيح أساليب القرآن على أساليب اليونان ورشف النّصائح الايمانيّة في كشف الفضائح اليونانيّة نگاشته گرديد . ابن سينا « مخنّث دهري » وكتاب شفاى أو « شقا » خوانده شد واز آن به سرمايهء « مرض » وبيمارى تعبير گرديد : قطعنا الاخوّة عن معشر * بهم مرض من كتاب الشّفاء فماتوا على دين رسطالس * ومتنا على مذهب المصطفى شناعت فلسفه ونفرت از فلاسفه به حدّى رسيد كه دانشمندى همچون ابن نجا اربلى در حال احتضار آخرين گفته‌اش : صدق اللّه العلىّ العظيم وكذب ابن سينا بود . عرصه بر فلسفه وفيلسوفان وآثار فلسفي چنان تنگ گرديد كه در مدينة السّلام يعنى بغداد ورّاقان وكتابفروشان را به سوگند واداشتند كه كتابهاى فلسفه وكلام وجدل را در معرض فروش نگذارند وكتابهايى نظير كتاب صون المنطق والكلام عن المنطق والكلام والقول المشرق في تحريم المنطق جلال الدّين سيوطى مورد پسند أهل دين وحافظان شريعت گرديد وأرباب تراجم در بارهء كساني كه به فلسفه وعلوم عقلي مىپرداختند ، مىگفتند : « دنّس نفسه بشيء من العلوم الأوائل » . در اين ميان بسيارى از دانشمندان كوشيدند تا اين شكاف ميان دين وفلسفه را از بين ببرند ولى موفّق نشدند از جمله آنان ناصر خسرو قباديانى بود كه كتاب جامع الحكمتين خود را نگاشت تا ميان دو حكمت يعنى حكمت شرعيّه وحكمت عقليّه آشتى دهد وجدال ونزاع ميان فيلسوف وأهل دين را برطرف سازد ولى در اين راه توفيقي به دست