26 - كتاب : تناقض أقاويل المعتزلة - 27 - كتاب : الرد على محمد بن بحر الرهني . 28 - كتاب : الفحص على مناهج الاعتبار . 29 - كتاب : الاستدلال في طلب الحق . 30 - كتاب : تثبيت المعجزات « 1 » . 31 - كتاب : الرد على من يقول أن المعرفة من قبل الموجود . 32 - كتاب : إبطال مذهب داود بن علي الأصبهاني . 33 - كتاب : الرد على الزيدية . 34 - كتاب : تحقيق وجوه المعرفة .

--> ( 1 ) قال العلامة المتتبع الميرزا عبد اللّه أفندي في رياض العلماء : من مؤلفات هذا السيد كتاب تثبيت المعجزات ، في ذكر معجزات الأنبياء جميعا ، ولا سيما نبينا ( صلّى اللّه عليه وآله وسلم ) وقد ألّف الشيخ حسين بن عبد الوهاب المعاصر للسيد المرتضى والرضي ( رحمهما اللّه ) تتميما لكتابه هذا ، كتابه المعروف بكتاب عيون المعجزات في ذكر معجزات فاطمة والأئمة الاثني عشر قال في آخره : كنت حاولت أن أثبت في صدر هذا الكتاب البعض من معجزات سيد المرسلين وخاتم النبيين ( صلّى اللّه عليه وآله ) الطاهرين الطيبين فوجدت كتابا ألّفه السيد أبو القاسم علي بن أحمد بن موسى ابن محمد بن علي بن جعفر بن محمد بن علي بن الحسين بن علي بن أبي طالب ( عليهم السلام ) سماه تثبيت المعجزات وقد أوجب في صدر طريق النظر والاختبار ، والدليل والاعتبار ، كون معجزات الأنبياء والأوصياء ( صلوات اللّه عليهم أجمعين ) بكلام بين ، وحجج واضحة ، ودلائل نيرة ، لا يرتاب فيها إلا ضال غافل غوي ، ثم أتبعها المشهور من المعجزات لرسول اللّه ( صلّى اللّه عليه وآله وسلم ) ، وذكر في آخرها : أن معجزات الأئمة الطاهرة ( صلوات اللّه عليهم أجمعين ) زيادة تنساق في أثرها ، فلم أر شيئا في آخر كتابه هذا الذي سماه كتاب تثبيت المعجزات ، وتفصحت عن كتبه وتأليفاته التي عندي وعند إخواني المؤمنين ، ( أحسن اللّه توفيقهم ) فلم أر كتابا اشتمل على معجزات الأئمة الطاهرين ( صلوات اللّه عليهم ) وتفرد الكتاب بها ، فلما أعياني ذلك استخرت اللّه تعالى واستعنت به في تأليف شطر وافر من براهين الأئمة الطاهرين ( عليهم السلام ) .