تحفة الأزهار عندما انتهيت من جمع المعلومات عن أماكن وجود هذا الكتاب القيم ، وحصلت على صور مخطوطاته ، آلمني - أشد الألم - أن يكون على هذه الحالة المؤسفة ، من توزع الأشتات ، وتناثر القطع ، وتفرق الأجزاء . وكان حصيلة الجهد الجهيد الذي بذلته في هذا السّبيل : نسخة كاملة من الكتاب تتكرر أحيانا ، وتنفرد أحيانا أخرى ، ولكنها متنوعة الخطوط ، ومتفاوتة الجودة ، ومختلفة الشّأن والقيمة ، منها ما هو بخط المؤلف ، ومنها ما هو منقول من أصل المؤلف ، ومنها ما هو مكتوب من قبل ناسخين لم يدققوا النظر ، ولم يحسنوا القراءة فصحفوا وحرفوا وشوهوا الأصل إلى أبعد الحدود . ونتيجة لهذا التنوع الكبير في أجزاء الكتاب وقطعه المتفرقة من قسّمناه إلى ثلاثة أقسام : القسم الأول : ما كان مكتوبا بخط المؤلف . وهي نسخة تقع ب 430 ورقة وعليها تملكه وختمه ، محفوظة في مكتبة السّيد محمد مشكوه مهداة إلى مكتبة جامعة طهران تحت رقم ( 992 ) . وهي نفس النسخة التي رآها السّيد محسن الأمين العاملي في مكتبة الشّيخ ضياء الدين بن الشّيخ فضل اللّه النوري في طهران ، - وكان ظنه صحيحا - أنها بخط المؤلف ( أنظر : أعيان الشّيعة 10 / 85 ) . وقد أشير إليها في : الذريعة 3 / 419 ، أعيان الشّيعة 26 / 304 ، فهرست كتابخانه مشكاة 2 / 532 ومما يظهر أن هذه النسخة كانت في الأصل أوراقا ، ثمّ تبعثرت وتفرقت فصارت أشتاتا ، وحين جمعت لتجليدها حدث خلط في جمع الأوراق فتقدم بعضها وتأخر البعض الأخر ، وضاعت منها أوراق كثيرة