الكتب المؤلفة في تفسير القرآن : ذكر 14 كتابا . الكتب المؤلفة في معاني القرآن ومشكله ومجازه : ذكر 25 كتابا . الكتب المؤلفة في غريب القرآن : ذكر 14 كتابا . الكتب المؤلفة في القراءات : ذكر 22 كتابا . الكتب المؤلفة في الوقف والابتداء في القرآن : ذكر 12 كتابا . الكتب المؤلفة في متشابه القرآن : ذكر 10 كتب . الكتب المؤلفة في فضائل القرآن : ذكر 12 كتابا . الكتب المؤلفة في عدد آي القرآن : ذكر 19 كتابا . الكتب المؤلفة في ناسخ القرآن ومنسوخه : ذكر 18 كتابا . الكتب المؤلفة في أحكام القرآن : ذكر 11 كتابا . وتتميز هذه المرحلة بأن لكل علم من علوم القرآن كتبا خاصة به ، فالكتاب الواحد لا يتناول إلا مباحث علم واحد ، فلم تكن المؤلفات الجامعة قد ظهرت بعد . المرحلة الثالثة : مرحلة المؤلفات الجامعة خصص ابن النديم الفن الثالث من المقالة الأولى من كتابه الفهرست ، لعلوم القرآن ، وقال في مطلعه : « الفن الثالث : في نعت الكتاب الذي لا يأتيه الباطل من بين يديه ولا من خلفه تنزيل من حكيم حميد ، وأسماء الكتب المصنفة في علومه ، وأخبار القراء وأسماء رواتهم » « 1 » . وما فعله ابن النديم هنا يمثل بداية اتجاه جديد للتأليف في علوم القرآن يتمثل بجمع خلاصة لعلوم القرآن كافة في مكان واحد ، بعد أن كانت كتب علوم القرآن يختص كل كتاب منها بمباحث علم واحد . وأشهر الكتب التي اتبعت هذا المنهج :

--> ( 1 ) المصدر نفسه ص 2 ، ويستغرق ذلك من كتاب الفهرست ص 27 - 42 .