واقع شد وپيوسته در منادمت وى بسر مىبرد واز اين رو محسود علماى آن ديار گشت ، وبه تهمت كفر وزندقة وانحراف عقيدتي صلاح الدين ايوبى را به قتل وى برانگيختند . آخر الامر در ماه رجب سال 587 وى را در قلعه‌اى زندانى كردند وبعد از نماز جمعه آخر ذي الحجة / 587 جنازة وى را از زندان بيرون آوردند . در كيفيت قتل وى آمده با موافقت خود أو بىخورد وخوراكش گذاشتند تا از گرسنگى جان سپرد ودر بعضي از تذكره‌ها آمده وى را در زندان خفه كردند وبرخى برآنند كه أو را در شهر حلب به دار آويختند وبعد از چند روزى جنازه‌اش را در بيرون شهر حلب نزديك محله مسيحيان دفن كردند . به حق قتل اين دانشمند بزرگ ونابغة جهان اسلامى در سنين جوانى وأيام أوج شكوفائى نيروى تفكر وتعقل از ضائعات بزرگ وجنايات فراموش ناشدني تاريخ انساني است . تاريخ قتل أو را به سالهاى 581 - 585 - 586 - 587 - 588 نوشته‌اند . ومصنّفات أو چنين آمده : 1 - المطارحات 2 - التلويحات 3 - حكمة الاشراق 4 - اللمحات 5 - الألواح العمادية 6 - الهياكل النورية 7 - المقاومات 8 - الرمز المومى 9 - المبدأ والمعاد بالفارسية 10 - بستان القلوب ودر بعضي نسخ آمده لسان القلوب 11 - طوارق الأنوار 12 - التنقيحات في الأصول ويا نفحات في الأصول 13 - كتاب في التصوف يعرف بالكلمة 14 - البارقات الإلهية 15 - النغمات السماوية 16 - لوامع الأنوار 17 - الرقيم القدسي 18 - اعتقاد الحكماء 19 - كتاب الصبر 20 - رسالة العشق 21 - رسالة في حالة الطفولية 22 - رسالة المعراج 23 - رساله روزى با جماعت صوفيان 24 - رسالة عقل سرخ 25 - رساله آواز پر جبرئيل 26 - رساله پرتونامه 27 - رساله الغربة الغربية 28 - رساله يزدان شناخت 29 - رساله صفير سيمرغ 30 - رساله لغت موران 31 - رسالة الطير 32 - رسالة في تفسير آيات من كتاب اللّه وخبر عن رسول اللّه صلّى اللّه عليه وآله 33 - رسالة غاية المبتدى 34 - التسبيحات ودعوات الكواكب