يعنى نسخهء عكسي شمارهء 1839 مجلس شوراى اسلامى با رمز « م » ونسخهء عكسي شمارهء 5023 برلين با رمز « ب » ونسخهء چاپ تركيه با رمز « ن » . در جريان تصحيح ، علاوة بر نسخ مذكور در موارد لزوم از منابع ديگر نيز استفاده شده است از جمله : آثار ابن سينا ، مثل طبيعيات الشفاء ، طبيعيات النجاة ، الإشارات والتنبيهات وشرحهاى خواجة نصير الدّين وفخر رازي ، المعتبر أبو البركات بغدادي ، آثار سهروردى مثل حكمة الإشراق ، طبيعيات المشارع والمطارحات ( خطّى ) ، طبيعيات التلويحات وشرح آن از ابن كمونة با نام التنقيحات في شرح التلويحات ، الحيوان اثر جاحظ ورسائل إخوان الصفاء والمباحث المشرقية اثر فخر رازي . تا حدّ امكان براي لغات نامأنوس كه در بخش طبيعيات بسيار به كار رفته است ، معادل فارسي در پاورقى آورده شده است . در پايان ، از جناب آقاى دكتر غلام رضا اعوانى رئيس محترم مؤسسهء پژوهشى حكمت وفلسفهء إيران كه با عنايت خاص نسبت به انتشار اين اثر همت گماشتند ونيز از فاضل ارجمند ، جناب آقاى دكتر سيد محمود يوسف ثاني كه اين جلد را همچون جلد أول با دقت ملاحظه كردند وتذكرات سودمند دادند سپاسگزارى مىكنم وبراي به انجام رساندن آخرين بخش آن‌كه در حوزهء حكمت الهى است از خداى بزرگ يارى مىخواهم . وآخر دعوانا أن الحمد للّه ربّ العالمين . نجفقلى حبيبي گروه فلسفه وكلام اسلامى دانشكدهء الهيات ومعارف اسلامى دانشگاه تهران 7 آذرماه 1384 ش . / بيست وپنجم شوّال 1426 ق . مقارن با سالگرد شهادت حضرت امام جعفر صادق ( عليه السلام )